谁来帮帮忙啊,做一个使用MATLAB的有序样品聚类的程序

zhengsw46 2016-10-19 02:15:17
本人不是做程序的,但是做分析需要一个有序样品聚类分析的MATLAB程序,从网上找到了一些源程序,但是都不能用啊,跪求高手教我。
我的分析的样品是186x28的矩阵,使用Fisher最优分割法


http://wenku.baidu.com/view/c4ee8210551810a6f42486de
这个提供了一个程序,但我完全做不出来啊~~~~
跪求高手
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mhycsuft 2020-08-23
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同求一份,学生物的编程小白。手头有大量数据要分析,感谢!!!! miao_hy@126.com
qq_35102041 2019-07-21
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能传一份么?不胜感激! zhuoshao@163.com
zhengsw46 2017-11-09
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很久没有上这个帖子了,不好意思。 现在为止没有合适的程序,我不是做程序的,没有办法,直接用了SPSS软件里的K-means分类,大概也可以用。
suixinkong 2017-10-23
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找到合适的了吗?可以给我发一份有用的吗
jqm800 2017-02-20
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程序最终分割穷尽,要确定最优的分类数只能自己判断。一般再细分组间方差没有明显扩大就可以了。
xiaocongzhi 2017-02-18
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xyls_yy 2017-02-15
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有序聚类的分类个数怎么确定啊?
jqm800 2016-12-26
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好久没上了。原先说的我试了下,貌似有点问题。 重新写了个程序,自己简单测试没有问题。楼主试试看。 http://download.csdn.net/detail/jqm800/9721805 PS:如果样本数据比较大,计算会比较慢。
zhengsw46 2016-12-02
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谢谢楼上帮忙,我找别人帮忙做了一个,但只能算一组数据,还没给老师看。 然后,我真的不是很懂编程。。。 楼上的意思是不是用系统聚类方法,用ward法限定相邻的两个类比较?那就是修改算距离的那个m程序?怎么实现? 然后那个ward法是不是跟k-均值算法比较像啊?
jqm800 2016-11-23
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研究了下,fisher应该是使得类内离差平方和最小,如果是这样,用ward法进行分类结果应该与fisher一致,ward法是每次并类增加的离差平方和最小。
jqm800 2016-11-22
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这个没地方上传附件吗? 我的想法是修改matlab中的linkage.m文件,把其中判断类间距离的语句限制为相邻类之间,这样聚类就不影响样本的排序。 除了average法不能用,其他都可以。 简单测试了下,可以工作。 不过是用系统聚类法,与fisher的算法有差异。
jqm800 2016-11-22
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楼主搞定没有?
zhengsw46 2016-10-19
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太感谢了,我在第一页上有个链接,有一个程序,是在百度上搜的,但我运行了,不成功,我也看不出来哪不对
Symfund 2016-10-19
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会点编程的,都会实现出来,看看有没有人比我先贴代码出来
Symfund 2016-10-19
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收藏了,我现学现编,试试看。
zhengsw46 2016-10-19
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要是两三列,我也能算了,但是我这个有将近两百个样品了,没法手算啊,网上找的都说特别简单怎么怎么的,但我试了,就是没法算啊,我很发愁啊~~~~~
Symfund 2016-10-19
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地质学跟“集合论”很有相似性,都是分类学呀
Symfund 2016-10-19
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唉,小样本的可以用笔和纸搞定,大样本(DNA,地质)只能借助计算机了。
Symfund 2016-10-19
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Fisher's exact test, statistical significance, categorical data, p-value,
zhengsw46 2016-10-19
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我不是学数学的,我是学地质的,没学过编程,要是有软件直接解决,我也不会上这来了
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