有兴趣可进来计论此算法？

hcy8004 2002-05-28 01:58:22

有兴趣可进来计论此算法？
原题如下：
“最近出现了一种奇异的生物病毒，这种病毒侵染的范围很广。科学家们经研究发现，这种病毒的内部存在一环状DNA片段，而正常情况下，生物的基因总是呈线状排列的。
因此据Dr.X推测，病毒侵染某个生物的几率可能正是与此有关：被侵染生物的DNA中总是或多或少地存在着一些片段，它们与环状DNA片段中的一部分是相同的（可称之为“匹配”），而它们中最长的片段被侵染的可能性就越大。其后又有研究发现，某些生物被侵染的几率远大于其它生物，对此Dr.X推测，可能是因为环状DNA片段不仅可以部分地匹配被侵染生物的DNA片段，还可以循环地匹配。
例如如果环状DNA片段为abc(也可以表示为bca或是cab,但它和acb是不同的），被侵染生物的DNA为abbcabcabb,那么能被环状DNA片段匹配的最长片段就是bcabcab,那么能被环状DNA片段匹配的最长片段就是bcabcab,长度为7.
面对大量的实验数据，Dr.X希望你能够帮她设计一个程序，计算出被侵染生物的DNA中与环状DNA片段匹配的最长片段的长度。”
最好具体点。

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whb790824 2002-05-30

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不能编译通过

wanbaocheng 2002-05-30

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同意！！！

xf8zbf 2002-05-30

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说明真是少
这就是国人的程序

one_add_one 2002-05-30

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这个程序是那期擂台赛擂主的程序。

one_add_one 2002-05-30

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这个程序是那期擂台赛擂主的程序。

xiaoluoli 2002-05-30

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/*VC6编译通过*/
#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>

char v[1000],*k;
long max=0;
int n,w[128][1000],wl[128];

void slove(int l,int h){ /*动态规划求解*///////////无返回值
long a1[1000],b1[1000],*a=a1,*b=b1,*c,i,j,ma;
int t;
for (i=0;i<n;i++){
a1[i]=0;b1[i]=0;
}
t=k[l];
for (i=0;i<wl[t];i++)
a[w[t][i]]=1;
for (j=l+1;j<=h;j++){
t=k[j];ma=0;
for (i=0;i<wl[t];i++){
if (w[t][i]>0) b[w[t][i]]=a[w[t][i]-1]+1;
else b[w[t][i]]=a[n-1]+1;
if (ma<b[w[t][i]]) ma=b[w[t][i]];
}
if (max<ma) max=ma;
if (ma+h-j<=max) break;
t=k[j-1];
for (i=0;i<wl[t];i++)
a[w[t][i]]=0;
c=a;a=b;b=c;
}
}

int main()
{
FILE *fp;
int c[128][128],t=0,x=0;
long m,i,j,low=-1;
if ((fp=fopen("virus.in","r"))==NULL) exit(1); /*读入数据*/
fscanf(fp,"%d%s%ld",&n,v,&m);
if ((k=(char*)malloc(m+1))==NULL) exit(1);
//malloc应该是返回char*型的指针,但VC要加(char*)才能通过
fscanf(fp,"%s",k);
if (n==1){/*初始化数据*/
v[1]=v[0];v[2]='\0';n=2;
}
for (i=0;i<128;i++)
for (j=0;j<128;j++)
c[i][j]=0;
for (i=1;i<n;i++)
if (c[v[i-1]][v[i]]++==0) t++;
if (c[v[n-1]][v[0]]++==0) t++;
if (t<=2) n=2;
for (i=0;i<n;i++)
w[v[i]][wl[v[i]]++]=i;
for (i=0;i<m;i++) /*搜索剪枝*/
if (c[k[i]][k[i+1]]>0){
if (low==-1) low=i;
if (x==0) x=k[i];
else if (x>0 && x!=k[i]) x=-1;
}
else{
if (low!=-1){
if (x>0 && low<i-n && t>1) low=i-n;
if (max<=i-low)
slove(low,i);
low=-1;x=0;
}
}
if (max==0)
for (i=0;i<m;i++)
if (wl[k[i]]>0){
max=1;
break;
}
fp=fopen("virus.out","w"); /*输出结果*/
fprintf(fp,"%ld",max);
fclose(fp);
free(k);
return 0;
}
//指出点小问题

深水蔚蓝 2002-05-29

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这是前年的全国大学生数学建模的题目。

可以看看去年的《数学的实践与认识》有

深水蔚蓝 2002-05-29

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编译不通过

one_add_one 2002-05-29

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/*VC6编译通过*/
#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>

char v[1000],*k;
long max=0;
int n,w[128][1000],wl[128];

slove(int l,int h){ /*动态规划求解*/
long a1[1000],b1[1000],*a=a1,*b=b1,*c,i,j,ma;
int t;
for (i=0;i<n;i++){
a1[i]=0;b1[i]=0;
}
t=k[l];
for (i=0;i<wl[t];i++)
a[w[t][i]]=1;
for (j=l+1;j<=h;j++){
t=k[j];ma=0;
for (i=0;i<wl[t];i++){
if (w[t][i]>0) b[w[t][i]]=a[w[t][i]-1]+1;
else b[w[t][i]]=a[n-1]+1;
if (ma<b[w[t][i]]) ma=b[w[t][i]];
}
if (max<ma) max=ma;
if (ma+h-j<=max) break;
t=k[j-1];
for (i=0;i<wl[t];i++)
a[w[t][i]]=0;
c=a;a=b;b=c;
}
}

int main()
{
FILE *fp;
int c[128][128],t=0,x=0;
long m,i,j,low=-1;
if ((fp=fopen("virus.in","r"))==NULL) exit(1); /*读入数据*/
fscanf(fp,"%d%s%ld",&n,v,&m);
if ((k=malloc(m+1))==NULL) exit(1);
fscanf(fp,"%s",k);
if (n==1){/*初始化数据*/
v[1]=v[0];v[2]='\0';n=2;
}
for (i=0;i<128;i++)
for (j=0;j<128;j++)
c[i][j]=0;
for (i=1;i<n;i++)
if (c[v[i-1]][v[i]]++==0) t++;
if (c[v[n-1]][v[0]]++==0) t++;
if (t<=2) n=2;
for (i=0;i<n;i++)
w[v[i]][wl[v[i]]++]=i;
for (i=0;i<m;i++) /*搜索剪枝*/
if (c[k[i]][k[i+1]]>0){
if (low==-1) low=i;
if (x==0) x=k[i];
else if (x>0 && x!=k[i]) x=-1;
}
else{
if (low!=-1){
if (x>0 && low<i-n && t>1) low=i-n;
if (max<=i-low)
slove(low,i);
low=-1;x=0;
}
}
if (max==0)
for (i=0;i<m;i++)
if (wl[k[i]]>0){
max=1;
break;
}
fp=fopen("virus.out","w"); /*输出结果*/
fprintf(fp,"%ld",max);
fclose(fp);
free(k);
return 0;
}

one_add_one 2002-05-29