AppUpdater 组件如何覆盖原有老版本文件？

[GingerPiety]

我用vb.net+AppUpdater组件做程序升级，AppUpdater会在检测到服务器新版本程序下载到客户端，按照网上的示例做，下载的新版本不会覆盖老版本只会生成一个新的目录，如果原来的目录是1.0.0.0新的目录就是2.0.0.0，请问如何能直接用新版本文件覆盖老版本文件？
另外AppStart.exe和AppStart.config文件是否可以与程序文件放到一个文件夹，而不用单独将程序文件与其分开，请达人给一个思路和具体要使用的方法。