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文档中心为什么不能发贴子？有人管吗？
musicwind
2001-09-05 06:00:20
文档中心为什么不能发贴子？有人管吗？
17:36分开始就不行了。
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musicwind
2001-09-05
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gz!!!
利用R代码从UCSC XENA
下载
mRNA
, lncRNA, miRNA
表达
数据
并匹配
临床
信息
本文详细介绍如何使用 R 语言处理
TCGA
数据
，包括
表达
数据
ID 转换、识别对照组与肿瘤组、注释
mRNA
/lncRNA/miRNA 以及整合
临床
与生存信息。
新版
TCGA
数据
库学习：批量
下载
新版
TCGA
数据
TCGA
biolinks是一个R包，用于便捷地访问、
下载
和分析
TCGA
全库
数据
，包括转录组、甲基化、SNP、突变、
临床
等多种
数据
类型，并提供
数据
分析和可视化功能。相较于Xena，
TCGA
biolinks
数据
更新更及时，且官方推荐使用。该包支持批量
下载
，如
mRNA
、lncRNA、
临床
、miRNA、SNP、CNV和蛋白质
数据
，是研究
TCGA
数据
的理想工具。
R语言进行
TCGA
配对样本差异基因分析
本文介绍了如何从
TCGA
头颈
癌
数据
中挑选配对样本，通过DESeq2进行配对差异分析，并对比了与常规非配对分析的区别。结果显示，配对分析能更准确地揭示基因
表达
变化，适用于后续的火山图、GO和KEGG分析。
数据
挖掘：是时候更新一下
TCGA
的
数据
了
本文介绍了如何利用R包
TCGA
biolinks
下载
和处理
TCGA
项目中的
mRNA
、miRNA、SNV和CNV
数据
，包括获取版本信息、创建文件夹以及编写
下载
和预处理函数，以适应最新的
数据
格式更新。
TCGA
数据
下载
：R包
TCGA
2STAT介绍
本文详细介绍了R包
TCGA
2STAT的使用方法，包括RNASeq、miRNASeq、Mutation等各类癌症
数据
的
下载
，以及解决win系统下TAR未安装问题的对策。同时，分享了作者对于该包稳定性的个人看法。
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