一般都是通过web services/WCF查询服务器进行升级   
配置XML文件保存版本信息，查询服务器获取版本如是最新版本就不要升级   
还可使用smart client   
文件覆盖进行软件升级File.WriteAllText("test.bat",
@"@echo off
:run
del %1 >nul
if exist %1 goto run
del test.bat
");
ProcessStartInfo p= new ProcessStartInfo();
p.FileName = "test.bat";
p.Arguments = System.Reflection.Assembly.GetExecutingAssembly().GetModules()[0].FullyQualifiedName;
p.WindowStyle = ProcessWindowStyle.Hidden;
Process.Start(p);

http://topic.csdn.net/u/20090422/08/69f9713b-3982-4313-ab11-7fb6eefdcf93.html

最简单的是用 clickonce 部署代码。

1）原程序启动后检查版本号。如果不是最新的提示更新
2）若更新程序，另起一个进程，进行文件的下载
3）下载完成后提示，要求用户关闭当前程序，然后更新程序自动将文件复制到指定目录（或者替换原有文件）。
4）替换完成后提示更新成功，启动原程序。新进程退出

可采用Socket通信方式和.net框架的FtpWebRequest类来实现与FTP服务器通信和文件的下载，其中采用FtpWebRequest下载文件的部分代码如下，两种方式百度上都有代码，其中FtpWebRequest的客户端FTP类如下，其他的可以按着上面的步骤自己写
class FTP_Class
    {
        string ftpServerIP;
        string ftpUserID;
        string ftpPassword;
        FtpWebRequest reqFTP;

        public void Connecttest(string ftpServerIP, string ftpUserID, string ftpPassword)
        {
            // 根据uri创建FtpWebRequest对象
            reqFTP = (FtpWebRequest)FtpWebRequest.Create(new Uri("ftp://" + ftpServerIP));
            // 指定数据传输类型
            reqFTP.UseBinary = true;
            // ftp用户名和密码
            reqFTP.Credentials = new NetworkCredential(ftpUserID, ftpPassword);
        }

        #region 连接
        /// <summary>
        /// 连接
        /// </summary>
        /// <param name="path"></param>
        private void Connect(String path)//连接ftp
        {
            // 根据uri创建FtpWebRequest对象
            reqFTP = (FtpWebRequest)FtpWebRequest.Create(new Uri(path));
            // 指定数据传输类型
            reqFTP.UseBinary = true;
            // ftp用户名和密码
            reqFTP.Credentials = new NetworkCredential(ftpUserID, ftpPassword);
        }
        #endregion
       
        #region ftp登录信息
        /// <summary>
        /// ftp登录信息
        /// </summary>
        /// <param name="ftpServerIP">ftpServerIP</param>
        /// <param name="ftpUserID">ftpUserID</param>
        /// <param name="ftpPassword">ftpPassword</param>
        public void FtpUpDown(string ftpServerIP, string ftpUserID, string ftpPassword)
        {
            this.ftpServerIP = ftpServerIP;
            this.ftpUserID = ftpUserID;
            this.ftpPassword = ftpPassword;
        }
        #endregion
        
        #region 获取文件列表
        /// <summary>
        /// 获取文件列表
        /// </summary>
        /// <param name="path"></param>
        /// <param name="WRMethods"></param>
        /// <returns></returns>
        private string[] GetFileList(string path, string WRMethods)//上面的代码示例了如何从ftp服务器上获得文件列表
        {
            string[] downloadFiles;
            StringBuilder result = new StringBuilder();
            try
            {
                Connect(path);
                reqFTP.Method = WRMethods;
                WebResponse response = reqFTP.GetResponse();
                StreamReader reader = new StreamReader(response.GetResponseStream(), System.Text.Encoding.UTF8);//中文文件名
                string line = reader.ReadLine();
                while (line != null)
                {
                    result.Append(line);
                    result.Append("\n");
                    line = reader.ReadLine();
                }
                // to remove the trailing '\n'
                result.Remove(result.ToString().LastIndexOf('\n'), 1);
                reader.Close();
                response.Close();
                return result.ToString().Split('\n');
            }
            catch (Exception ex)
            {
                System.Windows.Forms.MessageBox.Show(ex.Message);
                downloadFiles = null;
                return downloadFiles;
            }
        }
        public string[] GetFileList(string path)//上面的代码示例了如何从ftp服务器上获得文件列表
        {
            return GetFileList("ftp://" + ftpServerIP + "/" + path, WebRequestMethods.Ftp.ListDirectory);
        }
        public string[] GetFileList()//上面的代码示例了如何从ftp服务器上获得文件列表
        {
            return GetFileList("ftp://" + ftpServerIP + "/", WebRequestMethods.Ftp.ListDirectory);
        }
        #endregion              

          

        
        #region 下载文件
        /// <summary>
        /// 下载文件
        /// </summary>
        /// <param name="filePath"></param>
        /// <param name="fileName"></param>
        /// <param name="errorinfo"></param>
        /// <returns></returns>
        public bool Download(string ftpfilepath, string filePath, string fileName, out string errorinfo)////上面的代码实现了从ftp服务器下载文件的功能
        {
            try
            {
                filePath = filePath.Replace("我的电脑\\", "");
                String onlyFileName = Path.GetFileName(fileName);
                string newFileName = filePath + onlyFileName;
                if (File.Exists(newFileName))
                {
                    errorinfo = string.Format("本地文件{0}已存在,无法下载", newFileName);
                    return false;
                }
                ftpfilepath = ftpfilepath.Replace("\\", "/");
                string url = "ftp://" + ftpfilepath;
                Connect(url);//连接 
                reqFTP.Credentials = new NetworkCredential(ftpUserID, ftpPassword);
                FtpWebResponse response = (FtpWebResponse)reqFTP.GetResponse();
                Stream ftpStream = response.GetResponseStream();
                long cl = response.ContentLength;
                int bufferSize = 2048;
                int readCount;
                byte[] buffer = new byte[bufferSize];
                readCount = ftpStream.Read(buffer, 0, bufferSize);
                FileStream outputStream = new FileStream(newFileName, FileMode.Create);
                while (readCount > 0)
                {
                    outputStream.Write(buffer, 0, readCount);
                    readCount = ftpStream.Read(buffer, 0, bufferSize);
                }
                ftpStream.Close();
                outputStream.Close();
                response.Close();
                errorinfo = "";
                return true;
            }
            catch (Exception ex)
            {
                errorinfo = string.Format("因{0},无法下载", ex.Message);
                return false;
            }
        } 
        #endregion

        
        
        #region 获得ftp上文件大小
        /// <summary>
        /// 获得ftp上文件大小
        /// </summary>
        /// <param name="filename"></param>
        /// <returns></returns>
        public long GetFileSize(string filename)
        {
            long fileSize = 0;
            filename = filename.Replace("\\","/");           
            try
            {
               // FileInfo fileInf = new FileInfo(filename);
                //string uri1 = "ftp://" + ftpServerIP + "/" + fileInf.Name;
               // string uri = filename;
                string uri = "ftp://" + filename;
                Connect(uri);//连接      
                reqFTP.Method = WebRequestMethods.Ftp.GetFileSize;
                FtpWebResponse response = (FtpWebResponse)reqFTP.GetResponse();
                fileSize = response.ContentLength;
                response.Close();
            }
            catch (Exception ex)
            {
                // MessageBox.Show(ex.Message);
            }
            return fileSize;
        }
        #endregion

               #region 获得文件明晰
        /// <summary>
        /// 获得文件明晰
        /// </summary>
        /// <returns></returns>
        public string[] GetFilesDetailList()
        {
            return GetFileList("ftp://" + ftpServerIP + "/", WebRequestMethods.Ftp.ListDirectoryDetails);
        }
        /// <summary>
        /// 获得文件明晰
        /// </summary>
        /// <param name="path"></param>
        /// <returns></returns>
        public string[] GetFilesDetailList(string path)
        {
            path = path.Replace("\\", "/");
            return GetFileList("ftp://" + path, WebRequestMethods.Ftp.ListDirectoryDetails);
        }
        #endregion
        
    }

3L好牛。 不过 这个自动更新要弄个小空间好像。。

最简单的是用 clickonce 部署代码。

这个还用问啊，到精华帖里面找。
顺手找给你算了
http://topic.csdn.net/u/20090422/08/69f9713b-3982-4313-ab11-7fb6eefdcf93.html?77976

http://lovefly.blog.51cto.com/914912/273217
这篇文章可以参考一下。不是我写的。