救命啊,php奇怪问题

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我有两段php代码。第一段代码是在硬盘上创建一个folder,然后用system调用linux的cp命令copy一些文件到这个folder。
第二段代码是更新后台mysql数据库的一些表。
两段代码分开执行,都没有问题。放在一块就死活不行,报错是前台extjs报出来的,说是与mysql通信错误,mysql的log也看不出什么问题。只能肯定不是语法,变量赋值啥的问题。
求高人们给点思路。
另外,在apache的log中也没有看出什么有用的信息
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