时钟很不匹配

[tianmen431906]

现在要开发一套数控装置的实时现场总线。
总线实时收发程序使用实时网卡的时钟中断信号；
数控程序使用RTX系统里的时钟。
两个程序在一台研华工控机上运行，数控程序依据RTX系统时钟产生数据并打入总线缓存，实时现场总线用实时网卡的时钟中断发送总线缓存的数据。

现在却发现这两个时钟很不匹配，RTX系统里的时钟在一个毫秒里可以比实时网卡的时钟慢20微秒。

实时总线的发送端是硬件发送，就是不管总线缓存里有没有新的数据，它都会按设定的周期发送缓存数据。
RTX系统时钟较慢，就会出现更新总线缓冲不及时的现象，导致数控程序上个周期产生数据被再次发送，系统出错。


如果在接收端加入判断机制，会影响系统实时性。
调节RTX系统时钟为每毫秒980微秒，可以一定程度上缓解这个问题，但是由于RTX里的时钟调节粒度为5微秒，所以不可以完全消除这个误差。

这是什么原因，一般怎么解决啊？