无聊的时候吼一声

2012-03-17 05:21:34 319 阅读 AI 写同款 · GEO 优化AI 选题数据监测一键分发 ›
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raw_count、tpm、fpkm、rpkm如何选择 转录组测序中常见的数据类型有：raw_count、tpm、fpkm、rpkm。本文进行简单辨析： 一、概念 1 raw_count RNA-seq数据中，raw_count一般是指mapped到基因外显子区域的reads数目。比如说htseq，STAR，或者RSEM等NGS分析流程计算产生的counts值。其中RSEM(RNA-Seq by Expectation-Maximization)，考虑到一条read 可能会匹配多个exon位置，故而其产生的为expected_count。 2 TPM 阅读详情
啊啊啊....
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