请问ITK如何读取mhd(.raw)类型的图像

jamesLBJ 2014-11-01 04:05:11

最近导师让我用itk和elastix做图像配准，并给了我一些配准的数据，其中就包括fixed.mhd，fixed.raw，moving.mhd，moving.raw这几个配准图像的数据。我知道mhd是头文件能够索引到raw文件的数据。请问如何用itk正确读取？

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奔跑的大马哈鱼 2017-03-27

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楼主可以把mhd和raw的数据给我发一份么，604695946@qq.com

wei404434065 2015-12-21

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你的elastx学的怎么样啊？怎么用elastix开发，手册写得太简略。

本文介绍了医学图像处理的基础知识，包括常见的DICOM、mhd+raw格式，以及世界坐标、解剖学坐标和图像坐标体系之间的关系。重点讲解了如何使用ITK-SNAP工具进行图像查看和处理，如调整对比度、重采样等，并提供了重采样代码示例。此外，还提到了医学图像项目中需要注意的事项，如数据预处理和网络训练策略。

本文聚焦医学图像处理，介绍用ITK库实现MHD格式图像的读写操作及元数据解析。先说明MHD格式特点与关键元数据字段意义，接着解析代码模块，包括图像类型与IO框架初始化、MetaImageIO工厂注册机制、元数据提取核心接口，还给出使用说明、完整代码及测试效果。

项目原本使用自己合并的raw和info.txt，VNet框架需raw和mhd文件。介绍两种将Dicom数据集转换成raw+mhd文件的方案，一是用itk-snap读取Dicom数据再导出，但处理大数据量效率低；二是用医学图像处理工具c3d，可通过编程批量处理。

本文介绍如何使用SimpleITK读取MHD和RAW格式的DICOM文件，这两种格式将元数据和图像分开存储，以提高读取效率。通过示例展示了如何获取图像数组及元数据信息。

本文介绍如何使用Python和SimpleITK将DICOM格式的医学图像转换为MHD和RAW格式，包括读取DICOM文件、获取图像尺寸、转换像素间距、设置图像原点、创建三维数组以及保存转换后的文件。

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