java工程部署eclipse

刚刚接触javaweb开发，
之前自己练习做的小项目都是把整个文件夹导入到了eclipse里。
最近开始工作打开eclipse都是里面的工程。不知道这是怎么回事。
问了组长，组长说最外面的只是把工程放到一起的文件夹而已。
但还是没有明白。希望各位能详细解释一下。
打个比方就是说我建了了一个A的文件夹web项目，里面有B,C,D三个文件夹。
但是打开ecelipse，里面分别有B,C,D三个项目。而不是一个A里面有B,C,D。
小弟之前练习都是把A导入进来的。而且服务器下的部署也不是整个一个A导入
了进来，而是分别把B,C,D导进来了。请各位大牛帮忙详细解释下 谢谢了。