怎么在下一代测序数据bam文件中产生indel标记

ytdx_fants 2015-11-20 11:25:52

图中是一条bam文件的格式我觉得不可以随便改read的数列
或者怎么做indel的标记然后又该如何转换为bam文件呢

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突变体 Mutserve是线粒体基因组的变异调用者，可检测序列数据中的同质和异质位点。和使用它。快速开始 Mutserve要求将经过排序和索引的CRAM / BAM文件作为输入。 curl -sL mutserve.vercel.app | bash ./mutserve 文献资料 mutserve的完整文档可以在找到。局限性当前，mutserve的重点是SNP调用，而不是indel。接触看。引文 Weissensteiner H，Forer L，Fuchsberger C，SchöpfB，Kloss-BrandstätterA，Specht G，Kronenberg F，SchönherrS.2016年。mtDNA-Server：云中人类线粒体DNA的下一代测序数据分析。核酸研究44：W64–9。

二代测序call indel 总结

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