git flow的问题

[beichen]

事情是这样的，自己在做一个项目，分为android版本和x86版本，两者之间有很大一部分文件（主要是算法文件)是相同的，只有一些针对平台的配置文件是不同的。
现在是比如我在x86分支上写算法，调好后要打个Patch到android上，这样感觉好麻烦，每次都要自己手动去同步这些同样的文件，所以我想问一下，有什么分支结构或是方法来解决这个问题吗？