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python读取lzo格式的文件
MaxsLee
2016-12-20 02:54:05
各位道友,请问有人使用过python读取lzo压缩包里面的数据吗?
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python读取lzo格式的文件
各位道友,请问有人使用过python读取lzo压缩包里面的数据吗?
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nieoding
2016-12-20
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https://github.com/jd-boyd/python-lzo
mr_
python
:用于 Crossbow 预处理阶段的
python
MR 脚本
介绍 下面的这些脚本是用
Python
编写的,用于替换Crossbow的预处理阶段的 Perl 脚本。 提供的
Python
脚本采用 MR 风格,这意味着与 Crossbow 的并行性较差的Perl脚本相比,它们以大规模并行方式执行。 大规模并行的代价是FASTQ数据的要求是: BZIP2存档,因为bzip2提供了可拆分的存档
格式
,但任何其他
格式
,如可拆分的
LZO
也可以使用。 Hadoop通过类似的sshfs访问FASTQ数据。 mapper.py
读取
每个 Hadoop 数据节点上的FASTQ块,定位标题行,并将 4 行
格式
转换为单行
格式
,由FASTQ块中的第 1、第 2 和第 4 行组成。 转换后的FASTQ标头是一个HASH1 'ed 字母数字,对于每个
读取
对 + 前面的“@”符号都是HASH1的。 最后添加".1"或".2" ,以便能够在以下代码中识别此
读取
。 reducer.p
MATLAB典型环节代码-signalproc:用于从Clarius扫描仪
读取
和处理原始数据的脚本和代码
MATLAB典型代码信号处理 该存储库包含脚本和其他代码,以
读取
和处理从Clarius扫描仪收集的数据。 每个
文件
夹都包含一个特定的项目,并且其中包含示例数据和用于
读取
,处理和显示数据的matlab /
python
脚本。 可以从Clarius扫描仪获取的数据包括: RF(原始射频数据) 智商(正交数据) 信封(B灰度) 拍摄模式 要启用原始数据捕获,可以按下模式菜单中的“波形”图标。 然后,扫描仪将在成像时缓冲原始数据。 要启用RF数据收集,可以按模式菜单中的RF图标。 然后,在以B模式扫描时,扫描仪将进行内部RF帧捕获。 不使用RF模式时,默认情况下会捕获IQ和包络数据。 启用RF模式时,默认情况下会捕获RF和包络数据。 下载原始数据 冻结了原始数据捕获后的成像后,捕获图像或捕获电影按钮将自动从扫描仪下载数据。 请注意,在所有情况下,都会获取打包的.tar
文件
,然后使用
LZO
压缩方案进一步压缩原始数据。 访问数据时,用户应确保在其操作系统上安装了用于解压缩
文件
的正确软件。 由于包可能很大,因此通过无线链接下载原始数据可能要花费一些时间。 对于单帧捕获,通常需要1-3秒的下载时间;对
pyspark读
lzo
示例
pyspark读
lzo
示例 网上关于
python
用spark读
lzo
示例少之又少,仅有的一两个还是错的,这个问题困扰了我两个星期,现在终于解决了,特此发布上来为还在坑中的朋友提供解决办法 网上的示例只是最基础的 from pyspark import SparkContext from pyspark import SparkConf conf = SparkConf().setMaster(“l...
随机
读取
lzo
压缩
文件
的方法
问题 在项目中需要随机
读取
LZO
压缩
文件
。经测试在本地,如果是顺序
读取
一个
lzo
压缩
文件
是没有问题的。但是如果想从一个
文件
的多个随机位置开始
读取
一行数据的话,还是容易出问题。最后的妥协方案是,每次随机
读取
一个偏移位置,就打开一次
文件
流。同时,以下是关键代码: FSDataInputStream in= fs.open(new Path(fileName));
lzo
In=new L
python
解压
文件
中哪个是安装包_
python
解压
文件
格式
的基本方法
应对多种压缩包
格式
的
python
库:patool。如果平时只用基本的解压、打包等操作,也不想详细了解各种压缩
格式
对应的
python
库,patool应该是个不错的选择。patool库支持的
格式
包括:7z (.7z, .cb7), ACE (.ace, .cba), ADF (.adf), ALZIP (.alz), APE (.ape), AR (.a), ARC (.arc), ARJ (.arj...
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