问个关于json解析的问题

.NET技术 > C# [问题点数:40分,结帖人shuihan20e]
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让计算变简单 华为RH2288HV3服务器评测

2016年4月,华为携FusionServer双路服务器亮相英特尔北京E5 v4至强处理器发布会。英特尔至强E5 v4处理器是基于Broadwell工艺架构的最新一代产品。  基于至强E5 v4处理器,华为FusionServer双路服务器支持计算核心数...

HMMerWindows环境下的安装

HMMerWindows环境下的安装遇到的困难...尽管在下在移动硬盘里装好了Ubuntu系统,但是日常用的系统还是Windows(移动硬盘带Ubuntu还是有点二的),因此想在Windows下安装HMMer。然而: 官网www.hmmer.org上没有Wi...

Hmmer安装与使用

 从功能基因研究的角度来讲,相关的搜索,比如从序列数据库中,找同源的序列,或者对一个一个新的基因功能进行鉴定,使用hmmer比使用blast有着更高的灵敏度已经更高的搜索速度,但其应用还远没有blast普及。...

CAZyme注释

CAZyme的数据来源于CAZyDB:www.cazy.org; ...   对CAZyme的注释步骤如下: 1. 从dbCAN中下载HMMs数据库 打开dbCAN网站的Download页面。下载其中的3文件:all.hmm.ps.len,dbCAN-fam-HMMs.txt,hmm

使用HMMER搜索PFam

1. 安装HMMer 2. 从ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/Pfam/releases/下载pfam数据库Pfam-A.hmm 3. 得到 PFAM 数据库的 HMM 文件。 HMM 文件是文本文件,需要将其变成二进制格式,以加快运算速度,同时进行压缩...

基于全基因组的基因家族分析的初尝试

以搜索ZEB的人类的基因.... 搜索已知数据库 1.在NCBI Gene上搜索ZEB1  点击summary 点击domain 点击Gene就可以看到有相同结构的Gene了   2.在UniProtKB上下载protein family list https://w...

利用PfamScan寻找同源基因家族

Pfam是一个蛋白家族数据库,其中Pfam-A是手工确定的高质量的蛋白家族,Pfam-B是自动注释的,是对A的补充。目前已更新到32.0,下载地址为ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/Pfam/releases/,任选一版本即可。 做保守...

推荐:蛋白在线比对网站

推荐:蛋白在线比对网站https://www.ebi.ac.uk/Tools/hmmer/提交条蛋白序列去调取数据库中库相似的蛋白序列。结果与blastp结果类似。但是比blastp结果多出来很多其他的东西,比如,结构域检测,序列的多重比对....

HMMER使用

对hmm文件建库 hmmpress [options] hmmfile hmmscan [options] hmmdb seqfile

hmmer 使用(转载)

从功能基因研究的角度来讲,相关的搜索,比如从序列数据库中,找同源的序列,或者对一个一个新的基因功能进行鉴定,使用hmmer比使用blast有着更高的灵敏度已经更高的搜索速度,但其应用还远没有blast普及,这里是...

EggNOG功能注释数据库在线和本地使用

文章目录COG简介eggNOG简介eggNOG mapper在线版eggNOG mapper本地版安装说明软件安装数据库下载基本使用HMMER方法diamond方法结果解读高级使用服务器共用内存模式宏基因组大数据模式同源检索功能注释附1. emapper.py...

基因家族鉴定分析实战操作手册

基因家族鉴定分析操作手册: 基因家族 基因家族鉴定 基因家族鉴定分析总结 1.下载基因组信息文件,gff,cds,pep,fasta文件: Ensembl下载地址:http://plants.ensembl.org/index.html 下载方法可参考:...

Cygwin安装和配置

windows下通过安装cygwin模拟linux环境,然后再安装hadoop,是种简单方便的方式。为hadoop准备的windows下cygwin环境安装过程如下: - 下载安装文件 最新的cygwin安装文件setup.exe下载地址在这里:...

如何获取一个基因家族的所有小麦基因

如何获取一个基因家族的所有小麦基因昨天有同学问如何获得谷子中一个基因家族的所有基因。谷子已经测过序,获得起来还是比较简单。想要获得一个基因组家族的所有基因,方法很多。比方说,IWGSCv1.0的基因功能注释...

「基因组注释」使用RepeatModeler从头注释基因组的重复序列

RepeatModeler可用来从头对基因组的重复序列家族进行建模注释,它的核心组件是RECON和RepatScout。...第步:为RepeatModeler创建索引数据库 BuildDatabase -name ath -engine ncbi Athaliana.fa # -engine ncb...

Hmmer using Guide

从功能基因研究的角度来讲,相关的搜索,比如从序列数据库中,找同源的序列,或者对一个一个新的基因功能进行鉴定,使用hmmer比使用blast有着更高的灵敏度已经更高的搜索速度,但其应用还远没有blast普及,这里是...

gem5运新spec2006(修改)

按照之前的那篇博客(地址:http://blog.csdn.net/wyj7260/article/details/8280278)运行spec2006时,只有两benchmark是可以运行的,其他的都出现了错误。 出现这些错误的原因是: 之前出现的那些错误是由于gem...

Windows使用Cygwin编译Redis 3.x

Windows使用Cygwin编译Redis 3.x

全基因组基因家族成员相关数据获取

、基本分析内容 数据库检索与成员鉴定 进化树构建 保守domain和motif分析. 基因结构分析. 转录组或荧光定量表达分析. 二、数据库检索与成员鉴定 1、数据库检索 1)首先了解数据库用法,学会下载你要分析...

安装get_homologues

get_homologues软件安装问题解决方案。

怎样在主机上安装deepin Linux

在写下这篇博客的时候,笔者已经连续使用deepin几个月了,昨天推荐了一个deepin上用的邮箱(暂且这么说吧),今天再补上一篇deepin的安装步骤,表示对deepin的感谢与支持。  对于笔者而言,deepin有以下...

MySQL服务端在Windows下下载与安装

对于初次接触的人,在网上搜索到的内容,看就蒙圈,反正是这样的,什么配置环境变量,启动命令行等等系列工作,这些内容都是必须的,主要是写一样的小白看的,从怎么下载,下载哪个版本,下载的版本...

cygwin完全安装步骤方法(组图)

我们可以到Cygwin的官方网站下载Cygwin的安装程序,地址是:   ... 或者直接使用下载连接来下载安装程序,下载连接是:   ...下载完成后,运行setup.exe程序,出现安装画面。直接点“下一步”,出现安装模式的...

无root权限安装Pfam的笔记

本文主要解决问题:you may need to install the Bio::Pfam::Scan::PfamScan module 1,需要先安装 HMMER3软件: ...然后解压,进入软件hmmer3所在目录,开始安装软件: ./configure --prefix=你想把软件安装...

宏基因组分析流程

分析步骤宏基因组Illumina Hiseq PE150/250 测序fastx 进行原始序列统计 ==平台==Seqprep 和Sickle进行质控后数据统计,基于原始测序数据,使用相应软件对其进行数据质控,剪切掉数据中的低质量及含N的reads,获得...

gem5中运行spec2006

步骤: 1. 购买或下载spec2006源码; 2. 参考Docs/install-guide-unix.html中的方法安装,进入spec2006目录,执行 ./install.sh,然后选择y执行; 3. 执行 . ./shrc (注意是点,空格,点,斜杠shrc。此为bash...

./configure –prefix 命令用法

在Linux上编译安装软件时,经常遇到./configure –prefix=usr这个命令。./configure –prefix 是什么意思呢?下面简单介绍一下./configure –prefix 的用法。...Configure是一个可执行脚本,它有很多选...

NAR-2018-dbCAN2鉴定宏基因组CAZYome碳水化合物相关基因

文章目录Science哈扎人CAZYome分析实例实例解读分析方法探索(顺藤摸瓜)dbCAN2——碳水化合物在线分析服务器dbCAN2简介在线分析本地软件和数据库下载Reference猜你喜欢写在后面 宏基因组数据分析中,经常会使用多种...

解决deepin报Failed to start Load Kernel Modules.的问题

每次开机报这错误,虽然不影响使用,但不解决总就得差点什么于是在网上找资料。 试过很多方法无效,这里就不列举了,只写有效的,其实解决很简单,只需要修改/etc/modules-load.d/modules.conf将里面的 bbswitch ...

Java经典编程300例(code)

目 录 第1章 Java语言概述 1 实例001 输出“Hello World” 2 实例002 输出控制台传递的参数 2 实例003 输出由“*”组成的三角形 3 实例004 输出符号表情 5 第2章 Eclipse开发工具 6 实例005 下载并运行Eclipse工具 7 实例006 为Eclipse安装汉化包 8 实例007 使用Eclipse注释代码 10 实例008 使用Eclipse格式化代码 11 实例009 安装WindowBuilder插件 12 实例010 开发计算器界面 14 第3章 Java语言基础 15 实例011 输出错误信息与调试信息 16 实例012 从控制台接收输入字符 16 实例013 重定向输出流实现程序日志 17 实例014 自动类型转换与强制类型转换 19 实例015 加密可以这样简单(位运算) 20 实例016 用三元运算符判断奇数和偶数 21 实例017 不用乘法运算符实现2×16 22 实例018 实现两个变量的互换 (不借助第3个变量) 23 第4章 流程控制 25 实例019 判断某一年是否为闰年 26 实例020 验证登录信息的合法性 27 实例021 为新员工分配部门 28 实例022 用switch语句根据消费 金额计算折扣 29 实例023 判断用户输入月份的季节 31 实例024 使用while循环语句与自增 运算符循环遍历数组 33 实例025 使用for循环输出杨辉三角形 34 实例026 使用嵌套循环在控制台上 输出九九乘法表 35 实例027 使用while循环计算1+ 1/2!+1/3!…1/20! 36 实例028 使用for循环输出空心的菱形 38 实例029 终止循环体 39 实例030 循环体的过滤器 41 第5章 数组及其常用操作 43 实例031 获取一维数组的最小值 44 实例032 将二维数组中的行列互换 45 实例033 利用数组随机抽取幸运观众 47 实例034 用数组设置JTable表格的 列名与列宽 49 实例035 使用按钮控件数组实现 计算器界面 51 实例036 通过复选框控件数组实现 添加多个复选框控件 52 实例037 使用选择排序法对数组排序 53 实例038 使用冒泡排序法对数组排序 55 实例039 使用快速排序法对数组排序 57 实例040 使用直接插入法对数组排序 59 实例041 使用sort()方法对数组排序 61 实例042 反转数组中元素的顺序 63 第6章 面向对象入门 65 实例043 自定义图书类 66 实例044 温度单位转换工具 67 实例045 成员变量的默认初始化值 68 实例046 单例模式的应用 69 实例047 汉诺塔问题求解 70 实例048 编写同名的方法 71 实例049 构造方法的应用 72 实例050 统计图书的销售量 73 实例051 两只完全相同的宠物 74 实例052 重新计算对象的哈希码 76 实例053 使用字符串输出对象 77 实例054 Java对象的假克隆 78 实例055 Java对象的浅克隆 80 实例056 Java对象的深克隆 82 实例057 序列化与对象克隆 84 实例058 深克隆效率的比较 87 第7章 面向对象进阶 89 实例059 经理与员工的差异 90 实例060 重写父类中的方法 92 实例061 计算几何图形的面积 93 实例062 简单的汽车销售商场 95 实例063 使用Comparable接口自定 义排序 96 实例064 策略模式的简单应用 98 实例065 适配器模式的简单应用 100 实例066 普通内部类的简单应用 102 实例067 局部内部类的简单应用 103 实例068 匿名内部类的简单应用 104 实例069 静态内部类的简单应用 105 实例070 实例化Class类的几种方式 107 实例071 查看类的声明 108 实例072 查看类的成员 110 实例073 查看内部类信息 112 实例074 动态设置类的私有域 113 实例075 动态调用类中方法 115 实例076 动态实例化类 116 实例077 创建长度可变的数组 117 实例078 利用反射重写toString()方法 119 第8章 字符串与包装类 121 实例079 将数字格式化为货币字符串 122 实例080 货币金额大写格式 123 实例081 String类格式化当前日期 125 实例082 字符串大小写转换 126 实例083 字符与Unicode码的转换 128 实例084 判断用户名是否正确 129 实例085 用户名排序 130 实例086 判断网页请求与FTP请求 132 实例087 判断文件类型 133 实例088 判断字符串是否为数字 135 实例089 验证IP地址的有效性 136 实例090 鉴别非法电话号码 137 实例091 将字符串转换成整数 139 实例092 整数进制转换器 140 实例093 获取字符串中汉字的个数 141 实例094 批量替换某一类字符串 142 实例095 查看数字的取值范围 144 实例096 ASCII编码查看器 145 实例097 判断手机号的合法性 146 实例098 用字符串构建器追加字符 147 实例099 去掉字符串中的所有空格 148 实例100 Double类型的比较 149 第9章 Java集合类框架 151 范例101 用动态数组保存学生姓名 152 实例102 用List集合传递学生信息 153 实例103 Map集合二级联动 155 实例104 不重复随机数组排序 157 实例105 for循环遍历ArrayList 159 实例106 Iterator遍历ArrayList 159 实例107 ListIterator逆序遍历ArrayList 160 实例108 制作电子词典 161 实例109 制作手机电话簿 162 第10章 常用数学工具类 164 实例110 角度和弧度的转换 165 实例111 三角函数的使用 166 实例112 反三角函数的使用 167 实例113 双曲函数的使用 168 实例114 指数与对数运算 169 实例115 高精度整数运算 170 实例116 高精度浮点运算 171 实例117 七星彩号码生成器 173 实例118 大乐透号码生成器 174 第11章 错误处理 177 实例119 算数异常 178 实例120 数组下标越界异常 179 实例121 空指针异常 180 实例122 类未发现异常 181 实例123 非法访问异常 182 实例124 文件未发现异常 183 实例125 数据库操作异常 184 实例126 方法中抛出异常 185 实例127 方法上抛出异常 186 实例128 自定义异常类 187 实例129 捕获单个异常 188 实例130 捕获多个异常 189 第12章 输入/输出 191 实例131 显示指定类型的文件 192 实例132 以树结构显示文件路径 193 实例133 查找替换文本文件内容 194 实例134 设置Windows系统的文件 属性 195 实例135 文件批量重命名 196 实例136 快速批量移动文件 197 实例137 删除文件夹中的.tmp文件 198 实例138 将图片文件保存到数据库 199 实例139 从数据库读取图片文件 200 实例140 窗体动态加载磁盘文件 201 实例141 删除文件夹中所有文件 202 实例142 创建磁盘索引文件 203 实例143 控制台记录器 205 实例144 防止创建多个字符串对象 206 实例145 合并多个文本文件 207 实例146 对大文件实现分割处理 208 实例147 将分割后的文件重新合并 209 实例148 读取属性文件单个属性值 210 实例149 向属性文件中添加信息 211 实例150 在复制文件时使用进度条 212 实例151 从XML文件中读取数据 213 实例152 读取Jar文件属性 214 实例153 电子通讯录 215 实例154 批量复制指定扩展名文件 217 实例155 分类保存文件 218 实例156 搜索指定文件夹中的文件 219 实例157 实现文件锁定功能 220 实例158 简单的投票软件 221 实例159 压缩所有文本文件 222 实例160 将压缩包解压到指定文件夹 223 实例161 压缩所有子文件夹 225 实例162 深层文件夹压缩包的释放 226 实例163 解决压缩包中文乱码 227 实例164 Apache实现文件解压缩 228 实例165 把窗体压缩成ZIP文件 229 实例166 解压缩Java对象 230 实例167 文件压缩为RAR文档 231 实例168 解压缩RAR压缩包 233 实例169 为RAR压缩包添加注释 234 实例170 获取压缩包详细文件列表 235 实例171 从RAR压缩包中删除文件 237 实例172 在压缩文件中查找字符串 238 实例173 重命名RAR压缩包中文件 239 实例174 创建自解压RAR压缩包 240 第13章 枚举类型与泛型 242 实例175 查看枚举类型的定义 243 实例176 枚举类型的基本特性 244 实例177 增加枚举元素的信息 245 实例178 选择合适的枚举元素 246 实例179 高效的枚举元素集合 248 实例180 高效的枚举元素映射 249 实例181 使用枚举接口遍历元素 250 实例182 使用泛型实现栈结构 251 实例183 自定义泛型化数组类 253 实例184 泛型方法与数据查询 254 实例185 使用通配符增强泛型 256 实例186 泛型化的折半查找法 257 第14章 Swing入门 259 实例187 从上次关闭位置启动窗体 260 实例188 始终在桌面最顶层显示窗体 261 实例189 设置窗体大小 262 实例190 根据桌面大小调整窗体大小 263 实例191 自定义最大化、最小化和 关闭按钮 265 实例192 禁止改变窗体的大小 267 实例193 指定窗体标题栏图标 267 实例194 设置闪烁的标题栏 269 实例195 实现带背景图片的窗体 270 实例196 背景为渐变色的主界面 271 实例197 随机更换窗体背景 273 实例198 椭圆形窗体界面 275 实例199 钻石形窗体 276 实例200 创建透明窗体 277 实例201 信息提示对话框 278 实例202 设置信息提示对话框的图标 279 实例203 指定打开对话框的文件类型 280 实例204 为保存对话框设置默认文件名 282 实例205 支持图片预览的文件选 择对话框 283 实例206 颜色选择对话框 285 实例207 信息输入对话框 286 实例208 定制信息对话框 287 实例209 拦截事件的玻璃窗格 289 实例210 简单的每日提示信息 290 实例211 震动效果的提示信息 292 实例212 制作圆形布局管理器 293 实例213 制作阶梯布局管理器 295 实例214 密码域控件简单应用 296 实例215 文本域设置背景图片 297 实例216 文本区设置背景图片 298 实例217 简单的字符统计工具 299 实例218 能预览图片的复选框 300 实例219 简单的投票计数软件 301 实例220 单选按钮的简单应用 302 实例221 能显示图片的组合框 303 实例222 使用滑块来选择日期 305 实例223 模仿记事本的菜单栏 308 实例224 自定义纵向的菜单栏 309 实例225 复选框与单选按钮菜单项 311 实例226 包含图片的弹出菜单 312 实例227 工具栏的实现与应用 314 实例228 修改列表项显示方式 315 实例229 列表项与提示信息 316 实例230 表头与列的高度设置 317 实例231 调整表格各列的宽度 319 实例232 设置表格的选择模式 321 实例233 为表头增添提示信息 323 实例234 单元格的粗粒度排序 325 实例235 实现表格的查找功能 326 实例236 应用网格布局设计计算 器窗体 327 第15章 多线程 329 实例237 查看线程的运行状态 330 实例238 查看JVM中的线程名 331 实例239 查看和修改线程优先级 333 实例240 休眠当前线程 335 实例241 终止指定线程 336 实例242 线程的插队运行 337 实例243 使用方法实现线程同步 339 实例244 使用特殊域变量实现线程同步 341 实例245 简单的线程通信 342 实例246 新建有返回值的线程 344 实例247 使用线程池优化多线程编程 346 实例248 哲学家的就餐问题 348 第16章 网络通信 350 实例249 获得内网的所有IP地址 351 实例250 获取网络资源的大小 352 实例251 解析网页中的内容 354 实例252 网络资源的单线程下载 355 实例253 网络资源的多线程下载 357 实例254 下载网络资源的断点续传 359 实例255 建立服务器套接字 362 实例256 建立客户端套接字 363 实例257 设置等待连接的超时时间 364 实例258 获得Socket信息 365 实例259 接收和发送Socket信息 367 实例260 关闭Socket缓冲 369 实例261 使用Socket通信 371 实例262 防止Socket传递汉字乱码 375 实例263 使用Socket传递对象 377 实例264 使用Socket传输图片 379 实例265 使用Socket传输音频 381 实例266 使用Socket传输视频 384 实例267 一个服务器与一个客户端 通信 385 实例268 一个服务器与多个客户端 通信 387 实例269 客户端一对多通信 389 实例270 客户端一对一通信 391 实例271 基于Socket的数据库编程 393 实例272 使用Proxy创建代理服务器 396 实例273 使用ProxySelector选择 代理服务器 397 实例274 聊天室服务器端 399 实例275 聊天室客户端 401 第17章 数据库操作 405 实例276 JDBC连接MySQL数据库 406 实例277 连接SQL Server 2005数据库 407 实例278 JDBC连接Oracle数据库 408 实例279 获取SQL Server指定数据 库中的数据表信息 409 实例280 获取MySQL指定数据库 中的数据表名称 411 实例281 查看数据表结构 412 实例282 动态维护投票数据库 414 实例283 SQL Server数据备份 416 实例284 SQL Server数据恢复 419 实例285 MySQL数据备份 422 实例286 MySQL数据恢复 424 实例287 动态附加数据库 425 实例288 生成SQL数据库脚本 426 实例289 表中字段的描述信息 429 实例290 将员工信息添加到数据表 430 实例291 添加数据时使用数据验证 431 实例292 插入用户登录日志信息 432 实例293 生成有规律的编号 433 实例294 生成无规律的编号 435 实例295 插入数据时过滤危险字符 436 实例296 复选框保存到数据库 437 实例297 把数据复制到另一张表中 438 实例298 批量插入数据 439 实例299 更新指定记录 440 实例300 在删除数据时给出提示信息 442

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