如何画选择清除分析图

呵呵哒12138 2018-07-22 11:54:27

如何根据vcftools计算的pi值和fst值画出选择清除分析图

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这两天在整理GWAS流程，发现绘制θπ选择消除分析图在网上只能找到计算π的代码，但是没有绘图代码，于是自己搞了一下，供大家参考。 vcftools --vcf AxiomGT1.calls.vcf --window-pi 1000 --window-pi-step 1000 --out GT1_pi 生成两个文件 GT1_pi.windowed.pi GT1_pi.log 使用GT1_pi.windowed.p文件通过R进行绘图 library(ggplot2) data<-read.

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