社区
下载资源悬赏专区
帖子详情
复杂性状遗传分析方法研究及其软件开发下载
weixin_39821260
2019-05-01 10:30:15
浙大朱军的学生的论文,朱军的数量遗传学造诣还是不错的,其他学科可借鉴,需装CAJVIEWER
相关下载链接:
//download.csdn.net/download/hyprc/2040723?utm_source=bbsseo
...全文
16
回复
打赏
收藏
复杂性状遗传分析方法研究及其软件开发下载
浙大朱军的学生的论文,朱军的数量遗传学造诣还是不错的,其他学科可借鉴,需装CAJVIEWER 相关下载链接://download.csdn.net/download/hyprc/2040723?utm_source=bbsseo
复制链接
扫一扫
分享
转发到动态
举报
写回复
配置赞助广告
用AI写文章
回复
切换为时间正序
请发表友善的回复…
发表回复
打赏红包
人工智能-机器学习-
复杂性
状
遗传
分析方法
研究
及其
软件开发
.pdf
人工智能-机器学习
重测序 软件工具包
linux 64位平台 静态编译的 应可以直接用。 生物信息 重测序 小软件 游戏 随着测序技术的持续革新,新一代测序技术的产生降低了测序成本并提高了测序通量,使得针对几百上千的样品进行DNA测序成为可能。其次当前模式作物和重要经济物种的基因组大多已经被测序,越来越多的科研人员转重测序
研究
。再次近几年很多
研究
员已经在相关杂志发表了很多个体重测序的
研究
了,个体重测序
研究
已经相当深入,很难有质的飞跃和重要的发现。最后对一个好的群体的
研究
对后期的更深入的
研究
十分有意义,如对重组自交系群体进行测序,可以快速构建
遗传
图谱,寻找重组热点和定位数量性
状
位点的精细范围;再如而对栽培群体和野生群体测序,通过全基因组的多态性比较,则可以快速寻找到受人工驯化受到选择的区域和相关基因。基于上面以及其它种种原因,群体重测序的
研究
越来越受到重视了,其中群体SNP检测和基因型判断则显得尤其重要,目前检测群体SNP的方法并不成熟,大多由个体SNP的基因型整合构成群体SNP的基因型,不仅带入了不少假阳SNP和位点基因型判断不准,而且很多群体中稀有SNP并没有被检测出来,这些都会后期生物意义的探究造成一定的干扰。本论文主要
研究
是在群体样品过多,测序大数据过大,计算机资源有限情况下,提供了用于群体SNP位点检测及判断基因型的新算法和新模型,使之更高效更准确检测出群体SNP位点以及判断出各个体在该位点的基因型。主要的
研究
结果如下: (1)在
研究
群体SNP的检测模型,最终实现了两种检测模型,即最大似然法模型和贝叶斯二项混合模型。并基于这两种检测模型的理论,在Linux平台实现其检测的功能,开发对应的软件GLFmuti和PopSNP,通过和现在的软件比较和发展趋势,新开发的软件检测结果大有提高并将得到广泛应用。 (2)为了减少机器误差以及减少各种人为操作不当,提高群体SNP的检测的准确度,本论文同时为前期过滤和比对各过程等过程提供相应的分析工具。 (3)本论文在检测群体SNP和判断基因型的同时,同时开发其它变异检测功能,并最终从原始数据到变异检测的每一个分析步骤都提供相应功能模块,最终设计提供出一套标准的分析流程,实现相关分析标准化。 这儿就是 重测序 分析的软件工具包 和对应的流程 。 相关论文可以到知网搜
下载
./iTool -h 看help 共有10 部分组成,别如下: Fatools Tools For Fasta Fqtools Tools For Fastq SOAPtools Tools For SOAP CNStools Tools For CNS Xamtools Tools For Sam,Bam Gfftools Tools For Gff Formtools Tools For Form convert Filetools Tools For File Othertools Tools For Other Gametools Tools For Game
biodiverse:多样性空间分析的工具
生物多样性 生物多样性是一种利用基于生物分类,系统发育,性
状
和基于矩阵(例如
遗传
距离)的关系以及相关的环境和时间变化的指数对多样性进行空间分析的工具。
下载
:Biodiverse可以从
下载
生物多样性支持以下过程: 地理,分类学,系统发生和矩阵空间中数据分布的链接可视化; 空间移动窗口分析,包括丰富性,地方性,系统发育多样性和β多样性; 空间约束的聚类分析; 空间受限区域种植者分析; 营业额模式的交互式可视化(例如beta多样性); 和 假设检验的随机化。 Biodiverse是开源的,并支持用户开发的扩展。 它既可以通过图形用户界面(GUI)使用,也可以通过用户编写的脚本使用。 支持300多个索引。 请参阅“页面。 屏幕快照可以在ScreenShots页面上找到。 可以在看到示例应用程序。 说明:可以通过位于(这些也都是通过这个页面右侧的链接维基访问)。 讨论组位
GWAS分析新软件 | GMATs:解析
复杂性
状
和复杂
遗传
机制的高效工具
终于向作者要来了PPT,在动物大会上听了这个做GWAS的软件,一直想学习,今天作者回复了PPT内容,先分享一下。个人认为这款软件的特色: 1,可以进行多个随机因子的GWAS分析,比如重复力模型,窝别效应模型,母体效应模型,更符合育种的数据结构。 2,多性
状
GWAS分析模块(提升一因多效的检测功效,基因环境互作的GWAS分析) 3,纵向数据GWAS分析模块(比如测定日,随机回归模型,都可以进行GWAS分析了) 4,国内青年学者开发,中文说明文档,简单易用 飞哥在此立个Flag,好好学学这款软件,
GCTA学习8 | GCTA计算多性
状
遗传
力和
遗传
相关
快速阅读目录 1. GCTA计算两性
状
遗传
相关常用参数1.1 --reml-bivar(必须)1.2 --reml-alg 指定迭代方法(非必须)1.3 --grm(必须)1.4 --covar(非必须)1.5 --qcovar(非必须)1.6 --pheno(必须)2. 数据准备2.1 表型数据2.2 基因型数据2.3 协变量3. 构建GRM矩阵3.1 使用`Yang`的方法3.2 使用`Van`的方法4. 两性
状
估算
遗传
力和标准误5. GCTA的优势和不足 前面的几节中,我们介绍了GCTA计算G矩阵,和
下载资源悬赏专区
12,844
社区成员
12,391,044
社区内容
发帖
与我相关
我的任务
下载资源悬赏专区
CSDN 下载资源悬赏专区
复制链接
扫一扫
分享
社区描述
CSDN 下载资源悬赏专区
其他
技术论坛(原bbs)
社区管理员
加入社区
获取链接或二维码
近7日
近30日
至今
加载中
查看更多榜单
社区公告
暂无公告
试试用AI创作助手写篇文章吧
+ 用AI写文章