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2019-09-07 04:22:32
最近做一个课题,方向是结合全基因组和转录组分析肿瘤鉴定bio-marker。目前转录组部分已经完成,现在情况是有10个样本的全基因组数据,7个癌症,3个对应的癌旁,10个样本与参考序列比对,已经有了SNP,CNV等检测注释结果,下一步目的是筛选高频突变基因,7:3的样本并不一一匹配,变异应该怎么比较,接下来应该做什么分析呢?如果有参考的方法和文献请路过的诸位推荐。不胜感激
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最近做一个课题,方向是结合全基因组和转录组分析肿瘤鉴定bio-marker。目前转录组部分已经完成,现在情况是有10个样本的全基因组数据,7个癌症,3个对应的癌旁,10个样本与参考序列比对,已经有了SNP,CNV等检测注释结果,下一步目的是筛选高频突变基因,7:3的样本并不一一匹配,变异应该怎么比较,接下来应该做什么分析呢?如果有参考的方法和文献请路过的诸位推荐。不胜感激
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