刘永鑫Adam的留言板

刘永鑫Adam 2020-01-02 06:45:23
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鑫~仔 2022-12-06
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刘老师您好,在参考您的博客构建kraken2数据库时候,当运行kraken2-build --standard --threads 24 --db . 命令,出现了以下错误:

Downloading nucleotide est accession to taxon map...rsync: link_stat "/taxonomy/accession2taxid/nucl_est.accession2taxid.gz" (in pub) failed: No such file or directory (2)
rsync error: some files/attrs were not transferred (see previous errors) (code 23) at main.c(1668) [Receiver=3.1.2]

老师之前遇到过这种问题吗?kraken2是使用conda安装的

m0_62346637 2022-01-14
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刘老师您好,qiime最新版21.11,官网源很难下载,请问可以在github更新21.11的下载连接吗

Y1_ling 2021-12-23
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刘老师,您好,想问一下有哪里可以买到古菌SCM1的模式菌株吗?

weixin_47431457 2021-10-04
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db-RDA

肖蛮子 2021-08-26
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一直非常感谢刘老师的无私分享,学到了很多的知识,希望以后有机会可以认识刘老师。感恩

BAOZl 2021-05-21
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一直非常感谢刘老师的无私分享,学到了很多的知识,少走了很多的弯路。希望以后有机会可以认识刘老师。感恩
小車車 2021-01-14
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刘老师您好,我想请教您一个最近正在困扰我的问题,就是土壤中有些菌在无碳源的平板上也会生长且生长快速,请问您知道这是什么菌吗?琼脂无杂质
qq_53483401 2020-12-12
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刘老师好,我最近做空间向量AEM,MEM的工作。刘老师能不能推一些相关的文章
S羊羊 2020-11-17
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刘老师,您好!最近用cannoco5绘制RDA图片的时候,由于有12个处理,每个处理的重复又有4个重复,如果都体现在图中,加之环境因子会显得过于杂乱,请问是否有方式只显示12个处理在RDA图中?期待您的回复~
wangbotao0408 2020-11-12
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希望刘老师能出一期关于picrust2功能预测下机数据处理相关的博客,EC_metagenome_out和KO_metagenome_out输出的数据量很大,数据如何筛选,STAMP分析差异等问题希望老师能够讲解一下,此外是否有更为方便的工具处理功能预测数据?万分感谢!
qq_50287176 2020-08-23
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您好,请问怎样获取easycharts的下载,非常感谢!
Shammy222 2020-03-18
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老师您好,我想请问一下,为什么我的物种数据表格不能导入Canoco5,但是环境因子就可以呢
yooyoo2020 2020-03-16
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高颜值进化树
Njh8886 2020-03-13
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您好,dada2在Evaluate accuracy时,第一行报错Error in seqtab.nochim["Mock", ] : 下标出界。去掉了“,”之后没有报错,但是之后match那一步显示 Error in sum(sapply(names(unqs.mock), function(x) any(grepl(x, mock.ref)))) : 'type'(list)参数不对 请问该怎样解决呢?
weixin_43473429 2020-02-20
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> install_github("taowenmicro/EasyAovWlxPlot") Downloading GitHub repo taowenmicro/EasyAovWlxPlot@master checking for file 'C:\Users\hht-hp\AppData\Local\Temp\RtmpYleZTE\remotes1264730611ff\taowenmicro-EasyAovWlxPlot-a2f20fe/DESCRIPTION' ... √ checking for file 'C:\Users\hht-hp\AppData\Local\Temp\RtmpYleZTE\remotes1264730611ff\taowenmicro-EasyAovWlxPlot-a2f20fe/DESCRIPTION' - preparing 'EasyAovWlxPlot': checking DESCRIPTION meta-information ... checking DESCRIPTION meta-information ... √ checking DESCRIPTION meta-information - checking for LF line-endings in source and make files and shell scripts - checking for empty or unneeded directories - looking to see if a 'data/datalist' file should be added NB: this package now depends on R (>= NB: this package now depends on R (>= 3.5.0) WARNING: Added dependency on R >= 3.5.0 because serialized objects in serialize/load version 3 cannot be read in older versions of R. File(s) containing such objects: 'EasyAovWlxPlot/data/data_wt.rda' 'EasyAovWlxPlot/data/env.rda' WARNING: Added dependency on R >= 3.5.0 because serialized objects in serialize/load version 3 cannot be read in older versions of R. File(s) containing such objects: 'EasyAovWlxPlot/data/env.st.rda' 'EasyAovWlxPlot/data/ps1.rda' WARNING: Added dependency on R >= 3.5.0 because serialized objects in serialize/load version 3 cannot be read in older versions of R. File(s) containing such objects: 'EasyAovWlxPlot/data/ps2.rda' 'EasyAovWlxPlot/data/report.rda' - building 'EasyAovWlxPlot_0.1.0.tar.gz' Warning in utils::tar(filepath, pkgname, compression = compression, compression_level = 9L, : Warning in utils::tar(filepath, pkgname, compression = compression, compression_level = 9L, : 找不到'EasyAovWlxPlot/¦Ò??¦Ó¨¦?¦Ò¡é¨_.pptx'这个文件 * installing *source* package 'EasyAovWlxPlot' ... ** using staged installation ** R Error : (converted from warning) unable to re-encode 'FacetMuiPlotresultBar.R' line 53 ERROR: unable to collate and parse R files for package 'EasyAovWlxPlot' * removing 'D:/R/R-3.6.1/library/EasyAovWlxPlot' Error: Failed to install 'EasyAovWlxPlot' from GitHub: (converted from warning) installation of package ‘C:/Users/hht-hp/AppData/Local/Temp/RtmpYleZTE/file1264551749a/EasyAovWlxPlot_0.1.0.tar.gz’ had non-zero exit status
风中追风23 2020-02-17
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水稻发育时间序列分析的下载能提供下吗,谢谢
yunhan300 2020-02-13
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NHK 肠道细菌的1080P和720P的下载能提供下吗 谢谢
Xin Shui Bai 2020-01-12
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多发有关于根系分泌物这块的文章,很受用

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