mysql数据库无法dos命令连接操作，使用Navicat正常，且出现很诡异的现象！

[onlyao]

mysql版本：5.6.21
系统：windows server2012 R2
正常安装配置后，使用navicat能连接，等各种操作一切正常。因一直习惯了dos命令行操作，就尝试dos连接，却连不上，一直提示：
MySQl无法启动--Can't connect to MySQL server on localhost (10061)
按网上一些办法折腾几时，还是没解决，但是出现如下的诡异【经验不足，自我感觉】情况：
有某些网友提供了这么一个思路，可能是用户权限问题，于是执行了mysqld --skip-grant-tables，跳过验证
再使用mysql -uroot就能进入mysql控制台了！一顿操作，加用户，改权限什么的！
折腾半天，从Navicat进入myql.user表一看，内容并没有变，刚才操作的数据库和Navicat的库并不一样啊。
从系统服务中查看了mysql服务的my.ini配置文件，C:\ProgramData\MySQL\MySQL Server 5.6\my.ini,其中
datadir=C:/ProgramData/MySQL/MySQL Server 5.6/Data，这个为数据库目录。确定为Navicat正常链接的数据库目录。
后排查到：通过跳过验证方式，再使用dos 下mysql控制台进入操作的库的目录用的是
C:/Program Files/MySQL/MySQL Server 5.6\data 下的数据库.
DOS下show databases的结果：


Navicat中show databases的结果：


kill mysql相关的各种进程，重启服务后，Navicat依然正常。dos又不能使用了 ，必须要执行mysqld --skip-grant-tables才能进。但是
结果就是操作的库根本不是my.ini中指定的。希望有大佬指点迷津 ，谢谢！

附上my.ini指定库的mysql.user表内容【且通过其他电脑navicat能够远程连接并操作数据库】

localhost	root	password	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y					0	0	0	0			N
127.0.0.1	root	password	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y					0	0	0	0			N
::1	root	password	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y					0	0	0	0			N
%	root	password	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y	Y					0	0	0	0			N

[ACMAIN_CHM]

先检查 一下navicat 连接是哪儿的数据库？

[onlyao]

引用 1 楼 ACMAIN_CHM 的回复:

先检查 一下navicat 连接是哪儿的数据库？

确实就是本地服务器的。my.ini中datadir=C:/ProgramData/MySQL/MySQL Server 5.6/Data 下的库。

[ACMAIN_CHM]

检查一下变量，有些变量可以看出在哪台服务器上。比如 slow_query_log_file， general_log_file

[学海无涯-回头是岸]

连的不是一个库吧，你看你的MySQL 服务里面 指向的配置文件是哪个