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sentieon中文快速指南下载
weixin_39821051
2020-06-22 12:30:32
非常实用的sentieon实用快速指南,中文版。利于大家查阅。
相关下载链接:
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Sentieon
软件入门
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[可运行源码]
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软件是一款高效的基因变异检测二级分析工具,支持多种测序数据分析,包括WGS、WES、Panel等,并兼容第二代和第三代测序平台。该软件基于BWA、GATK等金标准数学模型,显著提升分析效率和精度。
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支持多种CPU架构,如Intel、AMD、ARM等,可部署于单机、HPC集群或云计算环境。软件团队拥有丰富的算法优化经验,服务全球1300+用户,被NEJM、Nature等顶级期刊引用。本文详细介绍了
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的运行环境要求、安装步骤、许可证设置及常见问题解决方案,帮助用户
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上手。
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一款非常
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的生信分析软件,是gatk完美的替代者。这里提供一个文件共大家分享。
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-dnaseq:
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DNAseq
已弃用。 更新的基准可在 将 GATK 生殖系管道的结果与
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匹配 介绍 本文档描述了
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DNAseq 管道匹配不同版本的 GATK 生殖系管道的功能。 如果您有任何其他问题,请访问或通过
Sentieon
Inc. 的技术支持。 输入和参考 NA12878的Fastq文件是从FTP站点
下载
的: ftp://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/giab/ftp/data/NA12878/NIST_NA12878_HG001_HiSeq_300x/140127_D00360_0011_AHGV6ADXX/Project_RM8398/ Hg38 和其他数据库是从 GATK 资源包
下载
的。 请参见此处: : 参数 文件 法斯塔 Homo_sapiens_assembly38.fasta known_Mills Mills_and_1
sentieon
-matching-performance:
Sentieon
GATK匹配工具的准确性和运行时基准
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匹配性能
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GATK匹配工具的准确性和运行时基准。 流水线 -
Sentieon
DNAseq管道与GATK最佳实践管道匹配,用于种系变异调用。 -
Sentieon
TNseq管道与GATK最佳实践管道匹配,用于体变体调用。
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