在Linux上没有办法下载hisat2，求各路大神帮忙看看

Shaquila_Chau 2021-01-15 11:12:40

本人生物信息小白，对Linux环境还在摸索中，我在Linux服务器上下载不了hisat2，请问该如何解决？

我试过在网页上是可以打开网站的，但是在Linux上就说没有办法解释host address
求解答！谢谢！

...全文

3266 1 打赏收藏转发到动态举报

写回复

1 条回复

切换为时间正序

请发表友善的回复…

发表回复

h2plus0 2021-01-15

打赏
举报

回复

这个是 https://github.com/infphilo/hisat2 源码，里面有Makefile, 一般输入 make 就可以编译了

HISAT2是一种专门为下一代测序数据比对设计的软件工具，它能够在全基因组、转录组和外显子组测序项目中实现快速且高灵敏度的序列比对。该程序采用了图FM索引（GFM）和分层图FM索引（HGFM）技术，这两种索引策略的...

hisat2-build.log

源代码包含了编译和安装指南，使得用户可以在不同的操作系统上轻松构建和运行Hisat。此外，该版本可能包含了一些bug修复和性能改进，以提供更稳定的服务。在实际应用中，Hisat通常与基于SAM/BAM格式的工具如...

HISAT2Aligner HISAT2是一种快速灵敏的比对程序，可将下一代测序读数（DNA和RNA）映射到人类基因组（以及单个参考基因组）。请参阅了解该算法的详细信息。

基于图的基因组比对和HISAT2和HISAT基因型的基因分型接触（）和（）抽象的下一代测序技术的飞速发展极大地改变了我们进行基因组规模分析的能力。用于大多数基因组分析的人类参考基因组仅代表少数个体，从而...

745

社区成员

900

社区内容

发帖

与我相关

我的任务

社区管理员

加入社区

近7日
近30日
至今

加载中

查看更多榜单

社区公告

暂无公告

试试用AI创作助手写篇文章吧

+ 用AI写文章