dcm2niigui.exe下载

PIPI_333 2021-03-14 01:01:14

转换图像格式的一种工具
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【代码】MRI学习笔记-原始数据转换与分割（dcm to nii）

dcm2nii命令是一个公司的老版本用的，可以去https://www.nitrc.org/frs/?group_id=152下载2016年版本里的文件。解压后会有一个dcm2nii.exe文件，我是win10系统，用pychram运行.sh文件需要下载git。网上教程一大堆就不说了全程默认下载即可。将下载安装后的git集成到pycharm（网上都有不说了，注意路径加上双引号）。想在pycharm的终端里运行.sh 需要将文件中第一行#!bin/bash注释掉，要不报错。

将Dicom格式转换为Nifti文件-方法1我们要做影像资料后处理分析，需要最常用到的软件是freesurfer、3D Slicer、spm12，但是他们不能直接处理标准dicom格式的文件，因此我们需要把dicom文件转换成NIFTI格式(analyze格式)。有多种方法可以将Dicom格式转换为Nifti文件，今天为大家介绍一种比较简单的方法。PET，MR，CT等数据都可以用这种方法...

mricron直接百度就可以下载，下载之后使用其中的dcm2niigui.exe做格式转换。原本的nii数据为4D格式，要选择时间点，有时放在MATLAB里面操作会报错。第一步：选择输出格式为SPM8（3D NIFIT nii）第二步：直接把要做格式转换的nii数据。直接点击ok后就可以转换了。

目前，脑成像数据主要有DTI、fmri、3D三种模态。这些数据在分析前都要进行格式转换，不同公司的扫描仪存储格式也不尽相同。脑成像处理软件也很多，不同软件使用的格式也不一样，所以数据转换是脑成像数据处理的第一步，必须非常清楚。这里主要以siemens的机器为准，介绍在windowx 下的MRIcron的dcm2nii转换和MRIConvert转换. 从扫描中心下载的原始数据是以dicom数据

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