请问大佬们,分子对接软件autodock安装后打开进度条一直在5%是怎么回事?(win7系统)

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AutoDock分子对接

分子对接 # 一、题目要求 自己寻找一个受体+药物分子复合物体系(不同配体结合3-4个),然后拿复合物结构作为起始,做对接实验。 软件自选,Dock, AutoDock… 二、操作过程记录及结果 1、软件下载与安装 ...

autodock-vina分子对接

autodock-vina分子对接 1.蛋白质的处理 从蛋白库里获取蛋白质的初始结构文件http://www.rcsb.org/ 这里我们选用3HTB蛋白复合物文件,用可视化软件打开pdb文件,这里选用pymol软件查看 我们去除掉水分子以及配...

AutoDock进行分子对接教程——半柔性对接

Autodock分子对接教程 Autodock是一款分子对接软件包,开源且免费,官方网址是http://autodock.scripps.edu/,目前最新的版本是AutoDock4.2.6,包括AutoDockAutoGrid两个模块,AutoDock软件包下载地址为http:...

AutoDock进行柔性分子对接教程

Autodock 柔性分子对接教程 First release:2018-9-22 Last update: 2018-9-22 四川魔德科技有限公司(www.modekeji.cn),专业从事分子模拟,量子化学等计算服务,欢迎咨询! Autodock是一款分子对接软件包,开源...

分子对接简要教程(autodock

使用autodock的小伙伴,按照这个步骤走一遍基本就会了。而且正式做东西的话,也基本是这个步骤。

在Win10的Ubuntu18子系统安装分子对接软件DOCK6.8

以前一直在windows下使用autodock vina,后来一些对接发现用vina无法验证,只能求助DOCK6.8(还是一个字:穷) DOCK6.8只能Linux下运行,不太想装Linux,发现windows store中有Ubuntu18.04的子系统,于是决定将...

Win10 桌面美化

Win10桌面美化 最近发现了几款Win10界面美化的软件,看了看...RocketDock 可以提供类似mac os的操作系统图标特效,打开安装包进行安装,完毕启动得到效果如下: 可以发现切换效果与mac类似,他默认的主题是 C...

分子对接教程 | (6) AutoDock对接操作与对接结果解读

TCGA|GEO|文献阅读|数据库|理论知识R语言|Bioconductor| 服务器与Linux接前文:分子对接教程 | (1) 软件安装准备分子对接教程 | (2...

C#基础教程-c#实例教程,适合初学者

C#基础教程-c#实例教程,适合初学者。 第一章 C#语言基础 本章介绍C#语言的基础知识,希望具有C语言的读者能够基本掌握C#语言,并以此为基础,能够进一步学习用C#语言编写window应用程序和Web应用程序。...

WPF学习

首先感谢刘铁锰先生的《深入浅出WPF》,学习WPF过程碰上很多新概念,如Data Binding、路由事件,命令、各种模板等。 WPF:编写CS端的UI技术。 怎么去掉WPF窗体靠上多出黑色的长条?...(我自己觉得偶尔会用用这个) ...

CentOS 7系统安装AutoDock Vina

AutoDock Vina官网:http://vina.scripps.edu/index.html点击打开链接 ... CentOS 7(64位)下安装AutoDock Vina cd autodockvina tar xzvf autodock_vina_1_1_2_linux_x86.tgz ./autodock_...

Mac及Linux安装Autodock及ADT

分子对接之前,我们首先要安装分子对接的工具,现在市场已经有很多有代表性的分子对接软件,如DOCKAutoDock、GOLD、Affinity等等。其中AutoDock是最常用的分子对接软件。 简介 AutoDock其实是一个安装包,...

WPF开发教程

------WPF开发教程 目录 WPF基础入门....... 1. WPF基础之体系结构......2. WPF基础之XAML....3. WPF基础之基元素......5. WPF基础之路由事件... 33 6. WPF基础之布局系统... 46 7. WPF基础之样式设置和模板化... ...

AutoDock安装及AutoDockTools闪退问题

AutoDock安装及AutoDockTools闪退问题AutoDockTools安装AutoDock安装检查ADT闪退问题解决方案 如题,之前我万万没想到会遇到闪退问题,是我一位同学遇到的,于是顺便把安装教程一起写了。考虑到生物系的小伙伴主要是...

Linux(CentOS 7_x64位)系统安装DOCK6.8

DOCK6 是UCSF(加利福尼亚大学洛杉矶分校)开发出的一套用于模拟分子对接软件。用于学术研究目的DOCK6 官网申请,申请时需要填写真实详细的信息(学校名称、网站地址、导师名称等等)。 官网点击打开链接 分子...

Mac小白倾听——如何完全卸载软件?Mac完全卸载软件教程

很多朋友反应用习惯了WINDOWS系统在使用Mac电脑时,都是有种种的不适应,一定会遇到的一个问题就是Mac上怎么卸载软件?内存不够的时候就很麻烦了。那么mac系统如何卸载软件?下面,小编给大家带来了mac系统卸载软件...

分子对接软件大比拼

文献报道过的或者没报道过的分子对接软件有很多,很多最初都是由实验室开发,免费发布。当软件很完善,没有什么缺陷时,可能会被专门的商业软件公司购买,就变成了某个大型软件包中的模块。 其实不止分子对接软件,...

AutoDock4和AutoDockTools4:具有选择性接收器灵活性的自动对接

自动对接已广泛用于结构/功能分析和分子设计中的生物分子复合物的预测。提供了数十种有效方法,在分子表示,能量评估和构象采样中采用了不同的权衡取舍,从而以合理的计算量提供了预测。 AUTODOCK结合了经验自由能力...

Mac打开软件在Dock栏上一直跳的解决办法

因为Mac打开软件时,会通过苹果的服务器进行软件签名的校验,这个过程中会有网络通信,如果你的网络不好,这个过程就会有点慢,导致软件一直在Dock栏上跳,而打不开应用。 怎么解决这个问题呢? 方法一:关闭网络 这...

蛋白-小分子对接

采用分子对接技术研究化合物1与受体PARP1的结合模式(图1)。 2.计算方法 从RCSB Protein Data Bank(http://www.rcsb.org)下载PARP1的X-ray晶体结构(PDB 编号:4RV6,分辨率:3.19 Å),以第一个构象作为受体...

UCSF DOCK6.8对接教程之蛋白分子表面和受体空间准备

准备蛋白质分子的表面文件(Chimera) 打开rec_noH.pdb,Action>Surface>show Tools>Structure Editing>Write DMS ,保存为rec.dms 生成受体空间(DOCK6.8) 将INSPH文件放入对接文件夹; INSPH ...

AutoDock ToolsUbuntu Kylin14、Ubuntu Kylin15下安装的详细安装步骤

AutoDock ToolsUbuntu Kylin14、Ubuntu Kylin15下安装的详细安装步骤 Ubuntu Kylin14、Ubuntu Kylin15下安装: Home文件夹即主文件夹下新建一个文件夹autodock(文件夹可以自己随意新建设置); 1. 登陆...

分子对接技术

分子对接(Molecular Docking)理论 所谓分子对接就是两个或多个分子之间通过几何匹配和能量匹配相互识别找到最佳匹配...分子对接计算是受体活性位点区域通过空间结构互补和能量最小化原则来搜寻配体与受体是否能...

UCSF DOCK6.8对接教程之准备受体和配体文件

UCSF DOCK6.8对接教程 DOCK6是UCSF(加利福尼亚大学洛杉矶分校)开发出的一套用于模拟分子对接软件。... 目前DOCK6最新的释放版本为DOCK6.8,其安装参考博文:Linux(CentOS 7_x64位)系统安装DOCK6...

CentOS 7(64位)系统安装AutoDockTools(MGLTools)

硬件环境: 获取安装包: ...CentOS 7(64位)系统安装MGLTools 获取root权限; 进入安装包所在文件夹; 赋予权限; 运行安装。 su root #获取root权限 chmod 755 mgltools_Linux-x86...

AutodDock安装及使用

AutoDock安装及使用AutoDock 4.2.6 Windows7中文版下的安装及运行 注意事项: 1、所有安装文件及后续处理文件的存储、安装、读取目录均不可有中文文件夹出现,文件名中除字母,数字及“_”外均不可使用。...

打造前端 Deepin Linux 工作环境——系统设置以及安装软件

打造前端 Deepin Linux 工作环境——系统设置以及安装软件系统的基本设置由于 deepin 系统做得太多,以至于,我们常见的 linux 上要进行的工作,基本上都不需要进行了。属于开箱即用的感觉。默认,任务栏是模仿MAC...

VSCode launch.json配置详细教程

主要介绍了vscode 的node.js debugger 的 launch.json 配置详情,本文通过实例代码给大家介绍的非常详细,对大家的学习或工作具有一定的参考借鉴价值,需要的朋友可以参考下

JAVA WEB开发实战

走进JSP、掌握JSP语法、JSP内置对象、Servlet技术、综合实验(一)——JSP使用Model2实现登录模块、EL表达式语言、JSTL核心标签库、综合实验(二)——结合JSTL与EL技术开发通讯录模块、JSP操作XML、JavaScript脚本语言、综合实验(三)——Ajax实现用户注册模块——可以轻松领会Java Web程序开发的精髓,提高开发技能。 快速提高自己的java web项目开发能力

从零基础开始用Python处理Excel数据.pdf

首先学习Python的基础知识,然后使用Python来控制Excel,做数据处理。 Excel使用者、Python爱好者、数据处理人员、办公人员等 第1章 python基础 1.1 什么是python? 1.2 为什么要学习用Python处理Excel表格? 1.3 手把手教你安装python程序 1.3.1 下载python 1.3.2 安装python 1.3.3 验证是否安装成功 1.4 安装Python集成开发工具PyCharm 1.4.1 下载 1.4.2 安装 1.5 Python的输入与输出

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