哪位大哥有去年ACM清华的题解啊,或数据也可以啊!(超超你有吗?)那道LCS怎么做啊?

jwd_1_cool 2004-04-17 11:04:03
哪位大哥有去年ACM清华的题解啊,或数据也可以啊!(超超你有吗?)

小弟拜求!特别是那道 Problem D :k-longest Common Sequence!
怎么做啊?讲讲也可以啊!
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jwd_1_cool 2004-04-24
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生物信息学上的解法是:
逐对(pairwise) 进行序列相似性判断,然后取最接近的进行求LCS,
然后再重复!

最后自然构成一条进化树!得到一个近似解!

这是根据生物链相近种群必然相似的原理,采用的一种DP+启发的算法。

最后,感谢大家捧场!特别是BLUESKY,小菜虎,mysword................
jwd_1_cool 2004-04-24
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交大朋友的回答:

去年北京所有题目的特征:规模是用来吓人的!

我按他理解应该是,找条最短的字串(因为LCS必然在它里面) 然后搜!
gnefuil 2004-04-23
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no, 我不是啊。。。。
BlueSky2008 2004-04-23
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up,mysword,你是nju的吗?
jwd_1_cool 2004-04-22
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mysword ,麻烦你在bbs.nju上问问海星吧!
jwd_1_cool 2004-04-21
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啊,我看了好久的最大流啊!
gnefuil 2004-04-21
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啊,以前的想法有错,重新想ing
让大家失望了,sorry
loewe 2004-04-21
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他还是高中生......
jwd_1_cool 2004-04-21
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恩!期待中!

另,小菜虎你是浙大的吗?
LeeMaRS 2004-04-21
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想听听mysword用网络流的作法,竞赛中的动态规划遇到维数障碍后似乎多半能转成网络流的。
LeeMaRS 2004-04-21
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如果是像常用动态规划算法的话,几个序列就需要几维,显然存在维数障碍的说……
jwd_1_cool 2004-04-20
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大家先讨论讨论如何 求三条序列的LCS啊!!

如:ATTGTTTCG
ATTCTTCGT
TTCGGGCTT
如何求啊?
jwd_1_cool 2004-04-20
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bio-informatics 上 讲到了waterman算法,就是我们常用的求LCS的算法,但是要求这道多个序列的,就是要用多维结构来求LCS。!
jwd_1_cool 2004-04-20
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谢谢!
你讲的这些我知道!
bio-informatic 谈的也是用DP,但是没有很详细的算法描述!

另:最大流怎么做啊?
BlueSky2008 2004-04-20
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严格的k条序列求最长公共子序列是NP hard.
已有的算法都是一些近似算法。
几乎可以肯定这个问题就是DNA多序列联配.连字母都没有变(DNA上的4种碱基A,T,G,C)你可以去找本生物信息学的书看看。
caocao123 2004-04-19
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很简单
jwd_1_cool 2004-04-18
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回 BlueSky2008(懒惰是程序员的美德) ,
按你的办法,得到的,很可能不是最长的啊! 这样还要用回朔啊!
好象不行啊!
mmmcd 2004-04-17
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题目很容易下载

数据找不到

当时场内没人做出D
tudou614 2004-04-17
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你有题目吗,有的话不妨公布一下,让高手来帮你做~~~~~~~~~~~~~~!!!!
gnefuil 2004-04-17
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公共串中的字母不一定是连续的吧。。suffix tree怎么做?
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