新建排水管道CCTV检测报告模板新版.doc下载

weixin_39821526 2022-03-19 13:30:56
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资源下载链接为: https://pan.quark.cn/s/9648a1f24758 FASTA格式是生物信息学中一种重要的文本格式,用于表示核酸和氨基酸序列。在该格式中,DNA的四种碱基(腺嘌呤、胸腺嘧啶、胞嘧啶和鸟嘌呤)分别用A、T、C、G表示,而RNA中胸腺嘧啶被尿嘧啶(U)替代。蛋白质序列则用20个单字母代码表示氨基酸,如苯丙氨酸用F表示,酪氨酸用Y表示。许多生物信息学数据库,如DIP和NCBI,都以FASTA格式存储大量生物序列数据供研究者使用。研究者在使用BLAST等序列比对工具后,比对结果也常以FASTA格式呈现。在分析这些序列时,研究者可能需要对特定功能域或功能位点进行研究,例如在蛋白质相互作用预测中,对氨基酸序列进行二联体(连续两个氨基酸)或三联体(连续三个氨基酸)特征编码分析,这有助于了解蛋白质的结构和功能。 为了满足对大型FASTA格式序列文件进行特定长度词条特征分析的需求,本文提出了一种新的算法——压缩索引树统计算法。压缩索引树是一种高效存储和检索序列数据的数据结构,该算法通过减少存储空间需求和加快查询速度,优化了现有的生物信息学分析工具,这些工具大多缺乏特定长度词条特征分析功能。在FASTA格式文件中,序列的统计是对28个字母的字符串进行的。文件中,序列说明行以“>”开头,后面是描述序列的文字,之后直到下一个“>”开头的说明行之间是序列本身。目前,常见的分析工具如matlab生物信息学工具箱、PexFinder和BLAST等,均未提供特定长度词条特征分析功能。 文章提到的作者初砚硕是生物信息学领域的学者,他在东北林业大学获得计算机应用技术硕士学位,还在大连理工大学分别获得生物工程和计算机应用技术(第二学位)学士学位。通信联系人刘亚秋也具备丰富的研究背景。FASTA格式作为生物信息学研究的基础,简洁地存储了大量核酸和蛋白质序列信息。随着生物信息学

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