IBM | 增强配体与靶标契合的小分子图生成模型

今天给大家介绍的是IBM研究团队发表在arxiv上的一项有关分子生成的研究。作者提出一种可以编码3D蛋白质-配体接触的图生成模型，该模型利用条件VAE从而可以预测在靶标结合口袋内的分子相互作用，从而实现特定活性的分子生成。实验结果表明，与基于配体2D生成方法相比，该方法生成的分子与多巴胺D2受体的结合口袋更契合。该研究展现了蛋白靶标的结构信息如何增强分子生成。小分子生成模型基于一系列深度学习架构设计的，其通常是要生成具有所需物化性质的分子，以增强化学家的创造力，并扩展传统数据方法或物理方法的规模。大部分模型