输出到平面文件(Flat File)

無名VF 2023-01-12 23:27:12

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尽管 MATLAB 生物信息学工具箱具有内生 GenBank 文件读取器 genbankread()，但有时难以读取这些具有意外但并非非正统格式的平面文件。该程序 gbread() 旨在用更通用的替代方案替换 genbankread()。与期望字段保持严格格式和顺序的 genbankread() 不同，gbread() 将每条记录作为文本行的元胞数组阻止，搜索字段，并使用 switch/case 设计处理它们。未识别的字段不会引起致命错误，而是作为文本块附加到输出结构中。基准测试显示，与 genbankread() 相比，gbread() 的速度惊人地提高了 10 倍。与 genbankread() 不同，gbread() 默认自动解析功能，但在关闭此选项时不会牺牲读取 CDS 条目的时间。总体而言，gbread() 为在 MATLAB 中读取 GenBank 平面文件提供了增

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