人体干细胞框架及肿瘤细胞形成推论下载

weixin_39821051 2023-11-20 19:00:18

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人体干细胞框架肿瘤细胞形成推论

本研究通过整合单细胞RNA测序、全外显子测序和拷贝数变异分析，系统解析了IDH野生型胶质母细胞瘤(GBM)的多层转录结构。研究发现了10类恶性细胞状态元程序，包括新鉴定的神经元样、胶质祖细胞样和纤毛样状态，揭示了GBM细胞状态的动态转换网络。通过通路分析拓展了7种功能元程序，发现约20%细胞呈现混合状态特征，提示细胞状态间存在转化。研究还开发了基于细胞状态控制的对照分析法，识别出影响多个恶性状态的肿瘤间异质性特征。这些发现为理解GBM异质性提供了新视角，并为靶向治疗和预后分层奠定了理论基础。

原文链接： https://www.embopress.org/doi/10.15252/msb.20188746 主编评语这篇文章最好的地方不只在于推荐了工具，提供了一套分析流程，更在于详细介绍了有哪些方法可用、什么时候用哪些方法和有什么注意事项。这也是我们易生信培训过程中广泛讨论的问题。 Abstract 单细胞RNA-seq使研究者能够以前所未有的分辨率研究基因表达图谱。这一潜力吸引着更...

摘要染色质调控区域在许多疾病过程和胚胎发育中起着关键作用。表观基因组测序技术，如染色质免疫共沉淀测序(CHIP-seq)和转座酶开放染色质高通量测序(ATAC-seq)，使我们能够通过检测特定的染色质状态及其相应的转录因子，在时间和空间维度上剖析细胞和组织的基因组调控格局。随着染色质免疫共沉淀芯片(CHIP-chip)技术的发展，大量的表观基因组分析技术已经出现，如CHIP-seq、DNase I超灵敏位点测序(DNase-seq)、ATAC-seq等。单细胞测序的出现使下一代测序发生了革命性的变化，在单

导读Konrad J. Karczewski, and Michael P. Snyder撰写的关于整合多组学在疾病研究中的应用一文《Integrative omics for hea...

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