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问一个简单的比对命令(50分)
ericxuwei
2005-03-19 10:05:07
a表b字段,c表d字段。b,d字段格式相同
要求判断b是否都在d中,如果有未被包含的b
将其记录显示出来。
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问一个简单的比对命令(50分)
a表b字段,c表d字段。b,d字段格式相同 要求判断b是否都在d中,如果有未被包含的b 将其记录显示出来。
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zhaoshaom
2005-03-20
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同上,如果要写入临时表的话加上
Select a.b From a Left Join c On a.b = c.d Where IsNull(c.d) INTO cursor 表
ericxuwei
2005-03-20
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多谢楼上各位!
cdbqss1
2005-03-20
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select * FROM a where a.b not in (select d from c )
JohnShen
2005-03-19
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Select a.b From a Left Join c On a.b = c.d Where IsNull(c.d)
ericxuwei
2005-03-19
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顶啊,拜托帮下忙,平时不大用,偶尔一用这个小功能。
muscle多序列
比对
简单
应用
没有深入研究,只想对多序列做个
比对
,然后
分
组,具体
命令
如下: 1、多序列
比对
(数据量不大,曾经用了
一个
挺大的,直接吐核,放弃了,网上有说多线程操作,没有用,照例吐) muscle -in seqs.fa -out seqs.afa 对于大数据集可以使用(我用了,直接报错,不知道咋回事,希望能有成功的宝宝) muscle -in seqs.fa -out seqs.afa -maxiters 2 2、序列
比对
分
组 muscle -in seq.afa -clw -out seq.clw ...
常用
比对
软件集合
比对
软件 来啦@-@,今天给大家
分
享一下几款小编常用的
比对
软件。 Bwa 适用范围:二代测序数据快速
比对
到genome上。 bwa作为序列
比对
界的模式软件,短小精悍,适用于多种场合,很有必要搞懂他内部的
比对
算法,最好也搞懂它是如何实现的。 建立索引: bwa index in.fasta 索引建立好之后会生成五个文件,后缀
分
别是: bwt,pac,ann,amb,sa 常见
比对
命令
: BWA-backtrack:illumina reads
比对
,最长支持100bp(aln/samse/sampe) bw
多序列
比对
要多久时间_Muscle进行多序列
比对
软件的主页是进入主页,
简单
看看软件介绍,这个软件还是蛮牛的,
一个
人在家里自己写出来的,当然,对于普通人来说,这个软件跟clustalW没什么区别,反正都是多序列
比对
啦!我们下载适合我们平台的版本即可!准备数据,我这里选择的是几个短小的蛋白这里有两种
比对
方式,都是很
简单
的
命令
一种是先
比对
,再生成树文件(树的格式是Newickformat,)muscle-inmouse_J.pro-out...
生信教程:多序列
比对
通过上述
命令
,BMGE 以 Fasta 格式在文件 16s_filtered.fasta 中写入过滤后的
比对
,并在文件 16s_filtered.html 中以 HTML 格式可视化过滤后的
比对
。为了避免下游系统发育
分
析中的
比对
错误导致的
问
题,我们将根据缺口的比例和这些区域内发现的遗传变异来识别
比对
不良的区域,并将它们从
比对
中排除。因此,当核苷酸序列用于系统发育
分
析时,第一步通常是推断不同类群序列中的哪些核苷酸彼此同源,以便这些核苷酸之间的差异仅源于序列进化中发生的变化。因此,该软件的安装是可选的。
snapgene怎么
比对
序列_多重序列
比对
(MSA)
分
析工具怎么选,看这一篇就够了
多序列
比对
(multiple sequences alignment,MSA)是开展进化生物学研究的前提,后续可以进行选择压力
分
析以及推断物种系统发育历史。多序列
比对
表示不同序列中的氨基酸/核苷酸的位点同源性。将序列
比对
用于进化
分
析时,处于相同位置的氨基酸/核苷酸位点则被认为在进化上是同源的,并且具有共同的祖先。通过研究序列
比对
中同源序列是如何随时间变化的,可以推断序列的结构和功能是如何...
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