无法正常登入windows时，如何备份软件下的数据资料？

[Old3Wolf]

我公司一台机器，作为SQL server,安装了本公司软件“教材管理软件”，这机器中毒后在手动清除时不知破坏了注册表，各种方法试过没有修复。现在的问题是，在正常登入windows时可很轻松地点击“备份数据库”来进行备份，现在如何才能做到不丢失软件下的数据呢？
想在C盘重装系统，在dos状态下用copy命令：copy c:\program files\jclj(教材软件文件夹） d:\BackFiles
copy c:\program files\SQL 2000 d:\BackFiles\SQL

这样将整个文件夹拷贝到D盘，有用吗？这样是不是会在重装系统后，不能打开以上文件夹找出其中以前的数据呢？
新手，请各位指教！

[Old3Wolf]

我把不能正常启动的硬盘挂在另一台机器上，但我发现已不能正常运行SQL及本公司软件“教材软件”了，这样把这两个文件夹都拷入非系统盘，再把C盘系统盘重装一下。
这种方法可以实现备份吗？在重装系统后，原先拷贝的文件夹中的数据会不会因系统重装，而无法恢复？
（备注：本机器是由SQL与“教材软件”结合，作为服务器使用的。）