算法实现题3-54 基因序列相似性问题

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算法实现题3-54 基因序列相似性问题
«问题描述：
Genotype 是一个有限的基因序列集。它的每个成员都是由大写的英文字母A-Z组成，
不同的字母表示不同种类的基因。一个基因种类可以分化成为若干新的基因种类。这种分化
一般呈树状结构。树根处的基因序列称为母序列。基因序列中含有母序列的基因子序列称为
本质基因子序列。生物信息学家们在研究Genotype 基因序列时，需要研究同一种类基因序
列的相似性。对于同一种类的2 个基因序列X 和Y，已知它们的母序列P，基因序列X 和
Y 的最长公共本质基因子序列给出其相似性的准确刻画。为了有效地分析基因序列的相似
性，科学家们希望设计出一个高效的计算程序，能对给定的基因序列X，Y 和它们的母序列
P，快速计算出基因序列X 和Y 的最长公共本质基因子序列的长度。
«编程任务：
给定基因序列X，Y 和母序列P，计算出基因序列X 和Y 的最长公共本质基因子序列
的长度。
«数据输入：
由文件input.txt提供输入数据。文件的前3 行中每行有一个正整数，分别表示序列X，
Y 和P的长度m，n和r（1≤m,n,r≤1000）。接下来的3 行给出序列X，Y 和P。
«结果输出:
将找到的基因序列X 和Y 的最长公共本质基因子序列的长度值输出到文件output.txt
中，如果基因序列X 和Y没有以P为母序列的公共本质基因子序列，则输出0。
输入文件示例 输出文件示例
input.txt output.txt
3
3
1
ABC
BCA
A
1

[LiChenYue]

排列组合加串匹配。