Linux C读写超大文件效率问题

xiaowhy 2011-08-24 07:16:20

各位高手帮忙看看，我这有几十G级别的比如60G文件需要读写，生成一些子文件，需要对原来文件的每一行进行解析；之前用fgets每一行的方法，客户对时间不是很满意；后来改用fork多个子进程，分段读取源文件，再生成不同的子文件，最后再把子文件合在一起，效果也不是很理想，逻辑不复杂，估计主要是IO的瓶颈；内存映射空间不够大吧，而且还要一行行的解析出来。
各位亲们不知有没有更好的办法啊?

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鼠 2011-08-26

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[Quote=引用 19 楼 xiaowhy 的回复:]
现在是有把文件分成几段，分子进程去读写，生成几个临时文件，再合并，直接用系统命令CAT,就是在合并的时候，速度又太慢，40G的文件要10分钟左右
[/Quote]
40GB 读 + 40GB 写 = 80GB I/O，平均下来有 136.5MB/s。

如果用的是单块硬盘这速度都快暴表了……你还想闹那样……

worldy 2011-08-25

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[Quote=引用楼主 xiaowhy 的回复:]
各位高手帮忙看看，我这有几十G级别的比如60G文件需要读写，生成一些子文件，需要对原来文件的每一行进行解析；之前用fgets每一行的方法，客户对时间不是很满意；后来改用fork多个子进程，分段读取源文件，再生成不同的子文件，最后再把子文件合在一起，效果也不是很理想，逻辑不复杂，估计主要是IO的瓶颈；内存映射空间不够大吧，而且还要一行行的解析出来。
各位亲们不知有没有更好的办法啊?
[/Quote]

文件以缓冲的形式打开，应该能有所改善，但是，60G实在是太大了，一行行fgets才是占用时间的关键，应该在这上面想办法优化

xiaowhy 2011-08-25

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多进程写同一个文件的话，又要去加锁啥的，估计也很慢

xiaowhy 2011-08-25

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[Quote=引用 16 楼 hgxxx007 的回复:]

给你个建议，用空间换时间。

你看看你地文本内容长度最大是多少，建议设定一个值：256或者128

然后如果每行不足256个字节，补足256字节。进行文件定位的时候直接seek到指定行。

如果内容不是简单的就知道行数，那么建议再创建一个外部索引，进行读写文件的时候只是先查看索引然后在进行读写文件指定位置。

如果你的需求更复杂一点，需要在中间插入和删除行。建议把大文件拆分成小文……
[/Quote]
现在是有把文件分成几段，分子进程去读写，生成几个临时文件，再合并，直接用系统命令CAT,就是在合并的时候，速度又太慢，40G的文件要10分钟左右

jackyjkchen 2011-08-25

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[Quote=引用 11 楼 hpsmouse 的回复:]

别急着优化程序，先算算现在的 I/O 速度是多少，要是已经达到了硬盘的速度上限程序再怎么优化都是白搭。

顺序读取大文件，内存映射其实没有直接读取快，不要碰到大文件就想着内存映射。
[/Quote]
至少对于Windows，内存映射的机制类似于异步IO，省去了同步等待ReadFile和WriteFile的时间，我做加密算法和Hash算法，处理大文件还是文件映射快

jngd 2011-08-25

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你要知道你地程序读取的IO大部分都是废IO，

那就说明程序的优化空间或者架构优化空间还非常非常大。

jngd 2011-08-25

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给你个建议，用空间换时间。

你看看你地文本内容长度最大是多少，建议设定一个值：256或者128

然后如果每行不足256个字节，补足256字节。进行文件定位的时候直接seek到指定行。

如果内容不是简单的就知道行数，那么建议再创建一个外部索引，进行读写文件的时候只是先查看索引然后在进行读写文件指定位置。

如果你的需求更复杂一点，需要在中间插入和删除行。建议把大文件拆分成小文件。然后外部任然通过一个索引文件进行索引。文件大小或者分片与否对上层不可见。

AnYidan 2011-08-25

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[Quote=引用 11 楼 hpsmouse 的回复:]
别急着优化程序，先算算现在的 I/O 速度是多少，要是已经达到了硬盘的速度上限程序再怎么优化都是白搭。

顺序读取大文件，内存映射其实没有直接读取快，不要碰到大文件就想着内存映射。
[/Quote]

硬件问题硬件解决

暮雨晨舟 2011-08-25

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不懂，帮顶！

jackyjkchen 2011-08-25

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[Quote=引用 23 楼 hpsmouse 的回复:]

引用 18 楼 jackyjkchen 的回复:
至少对于Windows，内存映射的机制类似于异步IO，省去了同步等待ReadFile和WriteFile的时间，我做加密算法和Hash算法，处理大文件还是文件映射快

内存映射也是等到缺页的时候才去读文件的吧？也是同步的才对。

刚刚在 Linux 下分别用 MD5 和每行的字符个数统计都试了一遍，内存映射比直接分块读取是要慢那么一点点……
[/Quote]

操作系统区别，Windows下内存映射优势很明显

csuhanyong 2011-08-25

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可以利用分页的思想去读吧？先读取100行显示出来，在101到200行

mLee79 2011-08-25

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mmap 就节约一次从内核空间到用户空间之间的拷贝, 其他速度上差别不大. 如果用 mmap 慢了就比较奇怪了.

这东西你还是优化优化处理过程吧, 要快的时候就 fread , fwrite , mmap 信得过. 这种东西瓶颈都在IO上, 多线程/进程没啥用的...

鼠 2011-08-25

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[Quote=引用 18 楼 jackyjkchen 的回复:]
至少对于Windows，内存映射的机制类似于异步IO，省去了同步等待ReadFile和WriteFile的时间，我做加密算法和Hash算法，处理大文件还是文件映射快
[/Quote]
内存映射也是等到缺页的时候才去读文件的吧？也是同步的才对。

刚刚在 Linux 下分别用 MD5 和每行的字符个数统计都试了一遍，内存映射比直接分块读取是要慢那么一点点，差距大概是几个 MB/s……

lamplet 2011-08-25

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有一点现在都没弄明白，当时想通过setvbuf修改缓冲大小来提高效率，没有看到任何效果。后来改成每次读取大段内容却有效。不知道问题出在哪里。

lamplet 2011-08-25

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我写过一个文件处理的程序，是顺序读取的。我不懂内存映射。只是自己把小段小段的读取，改成大段大段读取。减少文件读取次数，还是挺有效的。边界的问题，想办法处理下就好了。

不过，我也很想知道有什么经典的解决方法。老是做重复发明轮子的事情，浪费时间。还发明得比别人差，丢脸。

lightrat2009 2011-08-25

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[Quote=引用 19 楼 xiaowhy 的回复:]
引用 16 楼 hgxxx007 的回复:

给你个建议，用空间换时间。

你看看你地文本内容长度最大是多少，建议设定一个值：256或者128

然后如果每行不足256个字节，补足256字节。进行文件定位的时候直接seek到指定行。

如果内容不是简单的就知道行数，那么建议再创建一个外部索引，进行读写文件的时候只是先查看索引然后在进行读写文件指定位置。

如果你的需求更复杂一点……
[/Quote]硬盘的存储速度也就这么慢吧！！！

鼠 2011-08-24

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别急着优化程序，先算算现在的 I/O 速度是多少，要是已经达到了硬盘的速度上限程序再怎么优化都是白搭。

顺序读取大文件，内存映射其实没有直接读取快，不要碰到大文件就想着内存映射。

xiaowhy 2011-08-24

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[Quote=引用 9 楼 aaajj 的回复:]

以前碰到过类似的问题，IO是很大的瓶颈。写文件的时候，可以设置个较大的缓存，减少写的次数
[/Quote]
这个我也有加啊，一般8K左右最好吧

aaajj 2011-08-24

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以前碰到过类似的问题，IO是很大的瓶颈。写文件的时候，可以设置个较大的缓存，减少写的次数

jackyjkchen 2011-08-24

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[Quote=引用 7 楼 mangsong 的回复:]

引用 5 楼 qq120848369 的回复:
你的问题是I/O瓶颈,这个与海量数据处理没啥关系.

如果给预处理时间的话,那可以读大文件哈希到若干小文件,每个小文件可以直接映射到内存处理,这样的话利用两个线程并发遍历所有的文件,效率会高不少了,因为I/O问题已经不存在了 =,=

我想问下，我碰到过一个问题，对一个文件做MD5校验，当时我是用malloc申请的内存一次性读进来所有……
[/Quote]
md5支持分割校验，前提是你得有基础算法

md5基础算法一般是三个函数
init
process
done
其中process可以执行多次

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