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cuda实现字符串匹配
github_32016761
2015-12-18 03:44:23
求一份windows visual studio上实现字符串匹配的cuda 程序样例。thx!
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cuda实现字符串匹配
求一份windows visual studio上实现字符串匹配的cuda 程序样例。thx!
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CUDA
程序并行
实现
字符串匹配
的操作
本程序用
CUDA
编程在linux环境下
实现
并行的进行
字符串匹配
的操作。
基于图形处理单元的多
字符串匹配
算法
字符串匹配
是计算机科学中的一个基本问题。 它在搜索引擎,病毒检测,序列比对和许多其他应用中起着重要作用。 Aho-Corasick(AC)算法是一种广泛使用的多
字符串匹配
算法。 在本文中,我们提出了一种基于节点分组的交流自动机的空间压缩方法,并使用
CUDA
(计算机统一设备架构)在GPU平台上
实现
了交流算法。 在我们进行的几次实验中,我们的多字符串算法将算法在CPU上的加速至少存档了10倍。
AC算法的GPU
实现
字符串匹配
算法AC算法在GPU上的实例,基于
CUDA
平台,可调试
CUDA
agrep-开源
OpenMPagrep 和
CUDA
agrep 分别是用于近似 DNA
字符串匹配
的 agrep 算法的 OpenMP 和
CUDA
实现
。 OpenMPagrep 和
CUDA
agrep 都是免费和开源的。 用户可以自行承担修改源的风险。
Needleman_Wunsch_GPU
Needleman_Wunsch_GPU 概述 该代码
实现
了Needleman-Wunsch算法,以进行精确的
字符串匹配
。 要求 要编译,需要nvcc。 如果不可用,可以将Makefile修改为对.c文件执行gcc,而不对.cu文件执行nvcc。 指示 编译: make 跑步: ./nw [flags] 可选标志: -N
specifies the size of the strings to match -0 run GPU version 0 -1 run GPU version 1 -2 run GPU version 2 -3 run GPU version 3 NOTE: It is okay to specify multiple different GPU v
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CUDA™是一种由NVIDIA推出的通用并行计算架构,该架构使GPU能够解决复杂的计算问题。 它包含了CUDA指令集架构(ISA)以及GPU内部的并行计算引擎。
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