求助R语言GSEA分析

r_xiaobai666 2022-02-23 21:57:11

初学者，一直报错，球求大神指点迷津

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盖西用于基因组富集分析的R包

本文详细介绍了单基因GSEA（Gene Set Enrichment Analysis）富集分析的原理、方法和实现步骤。GSEA是一种用于评估基因集在表型相关基因排序表中分布趋势的方法，能够发现细微但协调性的基因表达变化对生物通路的影响。文章首先回顾了GSEA的基本原理，包括其定义、计算富集得分（ES）的方法以及显著性评估。随后，重点探讨了单基因GSEA分析的独特之处，即通过目标基因与数据集中其他基因的相关性分析，获得高相关基因集并进行富集分析。文章还提供了详细的R语言代码示例，包括数据导入、相关性计算、GO和KEGG富集分析以及结果可视化。此外，文中还解答了关于单基因GSEA分析的常见疑问，并强调了该方法在预测未知功能基因潜在生物学功能中的应用价值。最后，作者鼓励读者通过点赞、收藏和转发支持其内容创作，并提供了相关资源和往期教程的链接。

把input里面的数据替换成自己的数据，打开R，点Run，可以直接出图！文件适合有R语言基础的同学。

TCGA GEO数据处理，基因注释，差异分析，GO，KEGG，GSEA富集分析，肿瘤突变负荷，免疫浸润，LASSO回归，随机森林，SVM-RFE，COX回归，WGCNA网络，共识聚类分析，药物敏感性分析，干性指数，免疫浸润指数，预后模型等维度的相关R语言代码

多GSEA富集图_R语言绘制SCI图的输入文件及代码.rar

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